РУССКИЙ | ENGLISH
Главная | Карта сайта | Контакты | Вход
Поиск:
Контакты
НИИ медицинской генетики
Адрес:
Россия, 634050, г. Томск, Набережная реки Ушайки, 10
Телефон:
Приемная директора:
+7 (3822) 51-22-28;

Генетическая клиника
Адрес:
г.Томск, Московский тракт, 3 Регистратура:
+7 (3822) 53-05-37

Факс: +7 (3822) 51-37-44

Яндекс.Метрика





Forensic and population genetic characteristics of 62 X chromosome SNPs revealed by multiplex PCR and MALDI-TOF mass spectrometry genotyping in 4 North Eurasian population
В журнале Legal Medicine за 2016 год опубликована статья Степанова В.А. с соавторами Forensic and population genetic characteristics of 62 X chromosome SNPs revealed by multiplex PCR and MALDI-TOF mass spectrometry genotyping in 4 North Eurasian populations. Legal Medicine. 18 (2016) p. 66–71.

АННОТАЦИЯ

Х-хромосомные генетические маркеры широко используются в популяционной генетике и криминалистике. В данной работе представлены результаты анализа генетического разнообразия 62 Х-хромосомных SNP в четырех популяциях. В работе использовался метод мультиплексного генотипирования основанного на мультилокусной ПЦР и MALDI-TOF масс-спектрометрии. Проведена оценка информативности панели генетических маркеров (XSNPid) для криминалистики и популяционной генетики. Образцы ДНК исследованных индивидов  принадлежат к популяционным выборками коренных народов Сибири (буряты и хакасы), Северной Азии (ханты) и средней Азии (казахи). Выборки хантов, хакасов и казахов показали относительно высокий уровень среднего генетического разнообразия (>0,45). Только восточно-сибирские буряты показали низкий уровень средней гетерозиготности (0,436). Оценка генетической структуры с помощью анализа молекулярной дисперсии  (AMOVA) показала сравнительно низкий, но существенный уровень генетической дифференциации в группе 4 популяции (FST = 0.023, р = 0.0000). Панель XSNPid показала высокий уровень дискриминирующей способности  для каждой популяции. Среднее значение вероятности дискриминации неродственных индивидов у женщин (PDf) для панели XSNPid варьирует от 0.99999999999999999999999982 у хакасов до 0.9999999999999999999999963 у бурят. Это же значение для мужчин  (PDm) варьирует от 0.999999999999999792 до 0.999999999999999792. Разработанный мультиплексный набор, содержащий Х-хромосомные SNP может быть использован, как удобный инструмент для решения задач популяционной генетики, ДНК-идентификации и тестирования на родство. 

 

Vadim Stepanov, Ksenyia Vagaitseva, Vladimir Kharkov, Anastasia Cherednichenko, Anna Bocharova, Galina Berezina, Gulnara Svyatova Forensic and population genetic characteristics of 62 X chromosome SNPs revealed by multiplex PCR and MALDI-TOF mass spectrometry genotyping in 4 North Eurasian populations. Legal Medicine. 18 (2016) p. 66–71


просмотров: 619, опубликовано: 09.02.2016
вернуться к списку
Copyright © НИИ Медицинской Генетики Медиа-Ком : разработка сайта, веб дизайн, система управления сайтом