РУССКИЙ | ENGLISH
Главная | Карта сайта | Контакты | Вход
Поиск:
Контакты
НИИ медицинской генетики
Адрес:
Россия, 634050, г. Томск, Набережная реки Ушайки, 10
Телефон:
Приемная директора:
+7 (3822) 51-22-28;

Генетическая клиника
Адрес:
г.Томск, Московский тракт, 3 Регистратура:
+7 (3822) 53-05-37

Факс: +7 (3822) 51-37-44

Яндекс.Метрика





Панель однонуклеотидных сцепленных с Х-хромосомой полиморфных маркеров для ДНК-идентификации (XSNPid) на основе мультиплексного генотипирования с использованием методов многолокусной ПЦР и масс-спектрометрии MALDI-TOF
В 3 номере журнала Молекулярная биология за 2016 год опубликована статья сотрудников лаборатории эволюционной генетики: Степанов В.А., Вагайцева К.В., Харьков В.Н., Чередниченко А.А.,  Бочарова А.В. Панель однонуклеотидных сцепленных с Х-хромосомой полиморфных маркеров для ДНК-идентификации (XSNPid) на основе мультиплексного генотипирования с использованием методов многолокусной ПЦР и масс-спектрометрии MALDI-TOF. // Молекулярная биология. 2016. том 50, № 3, с. 445–456. 

АННОТАЦИЯ

Генетические маркеры человека, сцепленные с X-хромосомой (кратко – X-сцепленные), применяются в области популяционной генетики, медицинской генетики, а также для ДНК-идентификации индивида в криминалистике и судебной медицине. Нами предложена панель XSNPid, состоящая  из  66  несцепленных  однонуклеотидных  маркеров  Х-хромосомы,  и  разработан  протокол  их мультиплексного генотипирования с помощью методов многолокусной ПЦР и масс-спектрометрии MALDI-TOF. Панель XSNPid генотипируется в составе двух мультиплексов (на 36 и 30 маркеров). Разработанный протокол обеспечивает эффективное чтение генотипов: доля определяемых генотипов составляет 98.29%. Для русской популяции характерен высокий уровень генного разнообразия (0.461) по X-сцепленным SNP, включенным в панель. 63 из 66 маркеров, обеспечивающих высокую эффективность генотипирования и независимое наследование, пригодны для целей ДНК-идентификации. Для панели XSNPid характерна очень высокая дискриминационная способность при исследовании русской популяции. Вероятность совпадения генотипов у двух неродственных индивидов составляет 9 × 10 –27  для женщин и 2 × 10–18 для мужчин. При сравнении с другими ближайшими аналогами наборов X-хромосомных SNP, панель XSNPid обладает, кроме более высокой дискриминирующей  способности,  также  большей  емкостью  мультиплексов,  что  делает  ее  более экономически выгодной и требует меньших затрат времени при использовании. Панель XSNPid – удобный инструмент не только для индивидуальной ДНК-идентификации, но и для популяционно-генетических исследований.


 

Степанов В.А., Вагайцева К.В., Харьков В.Н., Чередниченко А.А.,  Бочарова А.В.Панель однонуклеотидных сцепленных с Х-хромосомой полиморфных маркеров для ДНК-идентификации (XSNPid) на основе мультиплексного генотипирования с использованием методов многолокусной ПЦР и масс-спектрометрии MALDI-TOF.// Молекулярная биология, 2016, том 50, № 3, с. 445–456

Stepanov V.A., Vagaitseva K.V., Kharkov V.N., Cherednichenko A.A., Bocharova A.V. Panel of X-Linked Single-Nucleotide Polymorphic Markers for DNA Identification (XSNPid) Based on Multiplex Genotyping by Multilocus PCR and MALDI-TOF Mass Spectrometry // Molecular Biology, 2016, Vol. 50, No. 3, pp. 387–397.


просмотров: 573, опубликовано: 09.06.2016
вернуться к списку
Copyright © НИИ Медицинской Генетики Медиа-Ком : разработка сайта, веб дизайн, система управления сайтом