НИИ
медицинской
генетики

Изучена ассоциация полиморфных маркеров IL12B (A1188C); IL12B (G3563753T); IL12RB (C2087T); IL12RB1 (G531A); IFNG(T-1488C); IFNGR2 (G-1704/del) c заболеваниями печени различной этиологии: хронический вирусный гепатит С (ХВГС), хронический вирусный гепатит В (ХВГВ) и алкогольная болезнь печени (АБП). Выявлены различия в частотах аллелей и генотипов у больных ХВГС по сравнению с контрольной группой для генов IL12B (A1188C) и IFNGR2(G-1704/-). Больные ХВГС характеризовались более низкой частотой генотипа АС (19,45%) по сравнению с контрольной группой (33,33%; р=0,01; OR=0,48; 95% CI: 0,27-0,88). Также в этой группе больных наблюдалось повышение частоты генотипа АА (76,21%) по сравнению с контролем (64,58%; р=0,05; OR=1,76; 95% CI: 0,99-3,12). У больных ХВГС выявлена более высокая частота генотипа GG (75,67%) и более низкая частота аллеля, несущего делецию - «-»(12,77) полиморфного варианта гена IFNGR2 (G-1704/-) по сравнению с контрольной группой (GG - 62,50%; р=0,02; OR=1,98; 95% CI: 1,08-3,37 и «-» - 19,27%; р=0,05; 0R=0,61; 95% CI: 0,37-1,00 соответственно). В группе больных с АБП выявлена повышенная частота носителей генотипа ТТ (8,9%) полиморфного варианта гена IL12B(G3563753T) генотипа СТ (59,5%) гена рецептора к IL12 - IL12RB1 (C2087T) по сравнению с контрольной группой (ТТ - 2,1%; р=0,05; 0R=4,64; 95% CI: 0,88-32,64 и СТ - 43,7%; р=0,04; 95% 0R=1,89; CI: 1,01-3,55 соответственно). Выявлены различия между группами больных ХВГС (12,7%) и ХВГВ (23,4%) в частотах аллеля, несущего делецию «-» гена IFNGR2 (G-1704/-) (р=0,01; 0R=2,11; 95% CI: 1,15-3,85).

Исследованы молекулярно-генетические факторы наследственной тромбофилии при гестозе различной степени тяжести у 140 русских женщин. Контрольную группу составили 150 недавно родивших русских женщин с физиологически протекавшей беременностью. Установлено, что наличие у женщин таких маркеров наследственной тромбофилии, как аллельные варианты С677Т и A1298C гена метилентетрагидрофолатредуктазы (MTHFR), маркер G20210A гена протромбина (FII), полиморфизм G1691A гена пятого фактора свертывающей системы крови (FV), мутация –675 4G/5G гена ингибитора активатора плазминогена (PA1-1) значительно увеличивает риск развития гестоза различной степени тяжести. Молекулярно-генетический анализ факторов наследственной тромбофилии может быть учтен при выборе эффективной профилактики гестоза.

The goal of this study was to analyze copy number variations (CNVs) in spontaneous abortions with a euploid karyotype, irrespective of the method used for CNV detection. This systematic review was performed in accordance with the PRISMA guidelines. Articles published between 2006 and 2023 were selected through the PubMed database. Studies were included if they involved CNV analysis in spontaneous abortions using any CNV detection method. The pathogenic significance of CNVs was interpreted based on the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) guidelines. Nineteen publications met the inclusion criteria. A total of 1425 CNVs were identified in 550 samples from 3953 euploid spontaneous abortions, representing 14% of the cases. Among the detected CNVs, 9% were classified as pathogenic, and 7.5% were likely pathogenic. The most frequently observed pathogenic CNVs included 22q11.2 deletion/duplication, 16p13.11 deletion, 15q11.2 deletion/duplication, 1p36.33 duplication, and 17p13.3 duplication. The genomic regions with the highest frequency of CNVs, regardless of their pathogenic effect, were 8q24.3, 16p13.3, 21q22.3, Xp22.33, Xp22.31, and Xq28. No clear associations were found between specific CNVs and pregnancy loss. However, deletions in the 22q11.2 region emerged as the most likely candidates contributing to lethality during the early stages of embryonic development.

Ischemic heart disease (IHD) is an important medical and social problem. ST-elevation myocardial infarction (STEMI) is the most severe form of IHD, affecting all layers of the heart muscle. One of the diagnostic criteria for endothe lial dysfunction in myocardial infarction is the level of sE selectin, a cell adhesion molecule that recruits neutrophils and induces neutrophil inflammation. The aim of this study is to investigate intronic polymorphisms rs5353, rs3917412 and rs1534904 of the E-selectin coding gene SELE in patients with STEMI. We have analyzed a group of patients with STEMI (n = 74) and a population sample of Tomsk (n = 136) as the control group. The frequencies of the rs5353 genotypes in the SELE gene have shown statistically significant differences between patients and the control sample (p = 0.004). The CC genotype is a predisposing factor to STEMI (OR = 6.93, CI:95 % (1.84–26.04), χ2 = 8.69, p = 0.002). The analyzed markers were not studied previously in cardiovascular diseases (CVDs) and were rarely involved in association studies at all; there is no information on these SNPs in the leading databases. At the same time, all three variants, according to the RegulomeDB classification, belong to the functional class 1f, and are highly likely to have regulatory potential rela tive not only to the SELE gene, but also to other genes in the nearby region. The analysis of the functional significance of the studied markers has shown the presence of a region more extensive than one gene, which is co-regulated by the studied nucleotide substitutions. The association of rs5353 with STEMI identified in this study once again confirms the involvement of the SELE gene in the pathogenesis of CVDs. It is possible that this entire region of the genome may be involved indirectly in the pathogenesis of CVD through the systems of inflammation, immune response and DNA repair.