The distribution of alleles and haplotypes of three diallellic Y-specific loci (YAP, DYF155S2, and Tat) in the populations of Kyrgyz, Uzbeks and Tajiks was analyzed. In Kyrgyzes and Uzbeks, a relatively high frequency of the DYF155S2 deletion (20 and 12.5%, respectively) and the C allele at the Tat locus (11.2 and 8.3%, respectively) were revealed. In the populations of southern Kyrgyzes and Uzbeks, two chromosomes carrying the YAP+ allele were detected. In both cases the YAP+ allele was found within the YAP+/DYF155S2+/TatT haplotype. The Tajik population was monomorphic in respect to the polymorphisms studied. The Tajiks demonstrated the presence of only the YAP–/DYF155S2+/TatT haplotype. This haplotype appeared to be most frequent in Kyrgyz (78.8%) and Uzbeks (83.3%). The question on the origin and the distribution of Y-chromosome variants in Eurasia are discussed.

Проанализировано распределение аллелей и гаплотипов трех диаллельных Y-специфических локусов (YAP, DYF155S2 и Tat) в популяциях кыргызов, узбеков и таджиков. У кыргызов и узбеков выявлена ​​относительно высокая частота делеции DYF155S2 (20 и 12,5% соответственно) и аллеля С в локусе Tat (11,2 и 8,3% соответственно). В популяциях южных кыргызов и узбеков выявлены две хромосомы, несущие аллель YAP+. В обоих случаях аллель YAP+ обнаружен в составе гаплотипа YAP+/DYF155S2+/TatT. Таджикская популяция была мономорфна по изученным полиморфизмам. Таджики продемонстрировали наличие только гаплотипа YAP-/DYF155S2+/TatT. Этот гаплотип оказался наиболее частым у кыргызов (78,8%) и узбеков (83,3%). Обсуждается вопрос о происхождении и распространении вариантов Y-хромосомы в Евразии.

Variation of Mongoloid-specific restriction sites of mitochondrial genome was analyzed in three territorial groups of Tuvinians. Distribution of mitochondrial DNA haplogroups A, B, C, and D on the territory of the Tuva Republic was estimated. The populations studied did not display distinct differentiation in respect to the mtDNA polymorphism. The specific feature of Tuvinian mitochondrial gene pool was the prevalence of only one haplogroup C (over 40%), mainly represented by two mitotypes. The high frequency of this haplogroup makes Tuvinians similar to more northern Siberian populations. On the other hand, the presence of haplogroup B indicates that Tuvinians have affinity to ethnic groups of Central Asia.

Проанализирована изменчивость монголоидно-специфических сайтов рестрикции митохондриального генома в трех территориальных группах тувинцев. Оценено распространение гаплогрупп митохондриальной ДНК А, В, С и D на территории Республики Тыва. Исследуемые популяции не проявляли четкой дифференциации по полиморфизму мтДНК. Особенностью тувинского митохондриального генофонда было преобладание только одной гаплогруппы С (более 40%), представленной в основном двумя митотипами. Высокая частота этой гаплогруппы роднит тувинцев с более северными сибирскими популяциями. С другой стороны, наличие гаплогруппы В указывает на родство тувинцев с этносами Средней Азии.

Polymorphism of three populations of the Buryat Republic and a population from Aginskii Buryat Autonomous okrug of Chita oblast was examined using a set of five autosomal Aluinsertions at theACE, PLAT, PV92, APOA1,and F13Bloci. The allele frequency distribution patterns revealed in Buryat populations were typical to other Asian populations. Buryats were characterized by relatively low level of intrapopulation diversity (0.369 in the pooled population sample). Analysis of autosomal Aluinsertions suggests the uniformity of the Buryat gene pool. The coefficient of genetic differentiation in the four populations studied was 0.8%.

Полиморфизм трех популяций Республики Бурятия и популяции Агинского Бурятского автономного округа Читинской области исследовали с использованием набора из пяти аутосомных Alu-вставок по локусам ACE, PLAT, PV92, APOA1 и F13. Выявленные закономерности распределения частот аллелей в бурятских популяциях были типичны для других азиатских популяций. Буряты характеризовались относительно низким уровнем внутрипопуляционного разнообразия (0,369 в сводной выборке населения). Анализ аутосомных Alu-инсерций свидетельствует об однородности бурятского генофонда. Коэффициент генетической дифференциации в четырех исследованных популяциях составил 0,8%.

Polymorphism of three rural populations of the Tuva Republic was examined using a set of five autosomal Aluinsertions at the ACE, PLAT, PV92, APOA1,and F13Bloci. The allele frequency distribution patterns revealed in Tuvinians were typical to Mongoloid populations of Asia and were characterized by relatively high frequency of the Alu-repeat insertion at the PV92and F13Bloci along with relatively low insertion frequency at the APOA1locus. With respect to the test systems used, Tuvinian populations examined displayed high levels of genetic diversity. The mean expected heterozygosity values in the populations of Kungurtug, Toora-Khem, and Teeli were 0.433, 0.407, and 0.437, respectively. The level of genetic diversity in the pooled Tuvinian sample was 0.432. The coefficient of genetic differentiation in the three populations studied was 1.4% pointing to relatively low level of genetic subdivision of the indigenous Tuvinian populations. However, estimates of genetic differentiation of the Tuvinian gene pool made by use of the Alu-repeat system were higher compared to those performed using classical protein systems, mtDNA, or Y-chromosomal haplotypes. Even though Tuvinian populations were characterized by common gene pool, some features specific to Western Tuvinian population could be distinguished. These features could be associated with higher contribution of the Caucasian component to the gene pool of this population. Phylogenetic analysis demonstrated close genetic relationships between the Tuvinian and Altaic ethnic populations.

Полиморфизм трех сельских популяций Республики Тыва исследовали с помощью набора из пяти аутосомных Alu-вставок в локусах ACE, PLAT, PV92, APOA1 и F13. Паттерны частотного распределения аллелей, выявленные у тувинцев, были типичны для монголоидных популяций Азии и характеризовались относительно высокой частотой инсерций Alu-повторов в локусах PV92 и F13 при относительно низкой частоте инсерций в локусе APOA1. Что касается используемых тест-систем, то исследованные тувинские популяции показали высокий уровень генетического разнообразия. Средние ожидаемые значения гетерозиготности в популяциях Кунгуртуг, Тоора-Хем и Теэли составили 0,433, 0,407 и 0,437 соответственно. Уровень генетического разнообразия в объединенной тувинской выборке составил 0,432. Коэффициент генетической дифференциации в трех исследованных популяциях составил 1,4%, что свидетельствует об относительно низком уровне генетической подразделенности коренных тувинских популяций. Однако оценки генетической дифференциации генофонда тувинцев, сделанные с использованием системы Alu-повторов, были выше, чем оценки, выполненные с использованием классических белковых систем, мтДНК или Y-хромосомных гаплотипов. Несмотря на то, что тувинские популяции характеризовались общим генофондом, можно выделить некоторые черты, характерные для западнотувинской популяции. Эти особенности могут быть связаны с более высоким вкладом европеоидного компонента в генофонд данной популяции. Филогенетический анализ показал тесную генетическую связь тувинского и алтайского этносов.

Using methods of mathematical statistics the relationships were determined between 31 anthropometric traits (ATs) and the frequency of the X-monosome cell clone in 53 patients with either 45,X-monosomy or mosaic forms (45,X/46,XX) of the Shereshevsky–Turner syndrome (STS). AT variations were studied in patients untreated with growth hormone and in 25 control fertile healthy women. In 29 patients, the degree of mosaicism was assessed by interphase FISH analysis using X-centromer-specific DNA probe hybridized to the cell nuclei of two types of tissues differing in embryonic origin (lymphocytes and oral epithelium, originating from meso- and ectoderm, respectively). The level of X-monosome mosaicism had a substantial effect on some AT, which depended similarly on the proportion of X-monosome cells in tissues of different embryonic origin. Statistically significant negative correlations were revealed between the size of X-monosome clone and 13 height–weight, longitudinal, and circumference traits, whereas positive correlations were characteristic of seven mostly width traits. Eleven ATs showed no correlation with the X-monosome cell clone. Discriminant analysis of all ATs, whose variations depended on the frequency of X-monosome cell clone, was found to be an essential tool for precise classification of both STS patients with different degree of mosaicism and healthy women. Based on these results, the set of ATs characteristic of the STS phenotype was identified

Методами математической статистики установлены взаимосвязи между 31 антропометрическим признаком (АТ) и частотой Х-моносомного клеточного клона у 53 больных с 45,Х-моносомной или мозаичной формой (45,Х/46,ХХ) Синдром Шерешевского-Тернера (СТС). Изучены вариации АТ у пациенток, не получавших гормон роста, и у 25 контрольных здоровых женщин фертильного возраста. У 29 больных степень мозаицизма оценивали методом интерфазного FISH-анализа с использованием Х-центромер-специфического ДНК-зонда, гибридизованного с ядрами клеток двух типов тканей, различающихся по эмбриональному происхождению (лимфоциты и оральный эпителий, происходящие из мезо- и эктодермы соответственно). ). Уровень мозаицизма Х-моносом существенно влиял на некоторые АТ, которые также зависели от доли клеток Х-моносом в тканях различного эмбрионального происхождения. Выявлены статистически значимые отрицательные корреляции между размером Х-моносомного клона и 13 росто-массовыми, продольными и обхватными признаками, тогда как положительные корреляции характерны для семи признаков, в основном ширины. Одиннадцать AT не показали корреляции с клоном клеток X-моносомы. Дискриминантный анализ всех АТ, вариации которых зависели от частоты клонирования клеток Х-моносомы, оказался важным инструментом для точной классификации как больных СМТ с разной степенью мозаицизма, так и здоровых женщин. На основании этих результатов был выделен набор АТ, характерных для фенотипа СТС.

In this investigation associations of gene complexes consisting of seven candidate for coronary atherosclerosis (ACE, AGT, NOS3, APOA1, MTHFR, PLAT, F13) with risk factors for CAD (lipid levels, blood pressure, body mass index (BMI)) were studied in Russian population. 94 male patients with CAD proven by angiography and 131 healthy individuals were involved in the case-control study. We observed a significant contribution of gene combinations (""ensembles""). ACE-MTHFR, ACE-F13, ACE-AGT-MTHFR in the variability of the total cholesterol and LDL-cholesterol levels. The ""Ensembles"" ACE-AGT-MTHFR were associated with variability of three atherogenic risk factors (LDL, BMI, cholesterol total). Two-locus gametic disequilibrium was analysed between gene polymorphisms. NOS3 and ACE, NOS3 and APOA1 were in gametic disequilibrium in the control group. Polymorphic markers of ACE and F13, NOS3 and F13, ACE and PLAT loci were in gametic disequilibrium in the patients. Both approaches (association analysis and gametic disequilibrium) revealed the same gene combinations contributing to the CAD risk factors. NOS3 and APOA1 markers were in gametic disequilibrium in the patients and both of them were associated with LDL. F13 and AGT were associated with systolic and diastolic blood pressure and two-locus gametic disequilibrium between F13 and AGT polymorphisms observed in the patients.