Проведено клинико-генеалогическое и молекулярно-генетическое изучение окулофарингеальной миодистрофии (ОФМД) в Республике Саха (Якутия). В исследование включены 33 неродственных якутских семьи с 38 больными и 2 русские семьи с 2 больными, а также 59 их здоровых родственников. В клинической картине больных с ОФМД наблюдается широкий клинический полиморфизм. У всех больных выявлена мутаиия в 1-м экзоне гена PABPN1, заключающаяся в увеличении GCG-повторов до 10. При прямом секвенировании гена PABPN1 в 17 семьях (16 - якутских, 1 - русская) установлен тип мутации - вставка 4 GCG-повторов. Частота ОФМЛ среди якутского населения - 1:11 680, что выше в 10-20 раз частоты, регистрируемой в Европе. Данное исследование является первым сообщением о больных с ОФМД из Республики Саха (Якутия) с подтвержденным молекулярно-генетическим диагнозом.

С целью определения клинических признаков дисплазии соединительной ткани у женщин с опущениями и выпадениями половых органов проведено обследование 30 пациенток в возрасте 35-77 лет. В работе использованы клинические и лабораторные методы обследования. Установлено, что при патологическом уровне оксипролина в моче встречаемость клинических признаков ДСТ имеет тенденцию к большей частоте на фоне II и III степеней опущения гениталий. При этом условии заболевание отличается более поздним началом и короткой продолжительностью. При наличии признаков ДСТ проявляется склонность к более высокой частоте рецидивов.

Врожденные пороки сердца и магистральных сосудов (ВПС) — серьезные аномалии развития сердечно-сосудистой системы (ССС), сопровождающиеся высокой летальностью на первом году жизни, и одна из главных причин детской смертности в целом. Для изучения этиологии, разработки профилактических мероприятий и планирования организации медицинской помощи детям с пороками развития необходимы точные данные по распространенности ВПС. С этой целью проводилось исследование частоты встречаемости и структуры пороков развития ССС у детей в возрасте до 1 года в Томске за 8-летний период (1999—2006 гг.). Определена частота врожденных пороков развития ССС— 9,2%о. Зафиксирован рост частоты детей с ВПС в указанной возрастной группе с 5,41 до 12,75%о, преимущественно за счет дефектов межпредсердной и межжелудочковой перегородок. Установленный в настоящем исследовании рост ВПС в значительной степени может быть обусловлен высоким качеством оказания специализированной кардиологической помощи населению Томской области.

Проведено обследование 1S1 больного раком легкого с целью изучения полиморфных вариантов генов ферментов 2-й фазы биотрансформации ксенобиотиков глутатион-S-трансфераз (GSTT1, GSTMI). Показано увеличение частоты патологического генотипа генов GSTTI, GSTMI) у больных раком легкого, которое оказалось более выраженным при мелкоклеточной опухши.

Идеальным инструментом для реализации эпидемиологических подходов к оценке воздействия ионизирующего излучения является медико-дозиметрический регистр. Региональный медико-дозиметрический регистр представляет собой систему взаимосвязанных информационных блоков, содержащих основные сведения о персонале Сибирского химического комбината. В настоящий момент база данных регионального медико-дозиметрического регистра персонала Сибирского химического комбината и населения закрытого административно-территориального образования Северск включает информацию относительно 138496 человек, из которых 65 538 – работники Сибирского химического комбината. Региональный медико-дозиметрический регистр персонала Сибирского химического комбината и населения ЗАТО Северск представляет основу для проведения комплексных исследований по оценке эффектов длительного воздействия ионизирующего излучения в диапазоне “малых” доз. Внесение информации не только относительно смертности, но и относительно заболеваемости, создание в структуре регионального медико-дозиметрического регистра “тематических” регистров наиболее значимых заболеваний дают возможность объективно оценить спектр соматико-стохастических эффектов и риски радиационного воздействия как у профессионалов и населения, так и у их потомков. Прикладная значимость регионального медико-дозиметрического регистра состоит в возможности формирования групп “риска” развития основных заболеваний в зависимости от спектра существующих факторов риска в определённых группах, для разработки оперативного планирования и проведения целенаправленных мероприятий диагностической и лечебно-профилактической направленности, а также последующей оценки их эффективности.

Проанализирован полиморфизм по однонуклеотидным заменам генов ферментов эксцизионной репарации ДНК (hOGG, XPD, XPG, XRCC1) у 98 работников Сибирского химического комбината, больных различными формами злокачественных новообразований, и у 148 здоровых человек. Не установлена связь исследованных полиморфизмов со злокачественными новообразованиями как в общей группе, так и в подгруппе лиц, подвергавшихся в процессе профессиональной деятельности воздействию ионизирующего излучения. Исключение составили гены hOGG и XPD, гетерозиготность по которым является протективным фактором в отношении злокачественных новообразований у облученных лиц: величина отношения шансов составила 0.42 (95%-ный ДИ 0.18–0.98; p = = 0.044) для генотипа 326Ser/Cys гена hOGG и 0.48 (95%-ный ДИ 0.23–0.99; p = 0.047) для генотипа 751Lys/Gln по гену XPD. Полученные данные свидетельствуют о возможной модифицирующей роли полиморфизма генов hOGG и XPD в отношении риска злокачественных новообразований у лиц, подвергающихся действию ионизирующего излучения.

The gene pool structure was studied for the indigenous population of the Sakha Republic (Yakutia). The composition and frequencies of Y-chromosome haplotypes in Yakuts were characterized. Six haplogroups were observed: C3×M77, C3c, N*, N2, N3a, and R1a1, N3a being the most common (89%). The gene diversity computed from the haplogroup frequencies was low in all samples examined. Gene differentiation was analyzed by AMOVA with two marker systems (haplogroup frequencies and Y-chromosomal microsatellite haplotypes) and was estimated at 0.24 and 2.85%, respectively. The frequencies and molecular phylogeny of the YSTR haplotypes were studied for the N3a haplogroup. In total, 40 haplotypes were found in Yakuts. Evenks and Yakuts displayed highly specific overlapping N3a haplotype spectra, atypical for other Siberian ethnic groups. Cluster analysis with N3a YSTR haplotypes showed that Yakuts are isolated from other Turkic-speaking populations of Southern Siberia. The genetic diversity generation time was estimated at 4450 ± 1960 years for the Yakut haplotype spectrum. In contrast to mtDNA data, the results suggest a significant contribution of the local Paleolithic component to the Y-chromosome gene pool of Yakuts. Ethnogenetic reconstructions were inferred from the diversity and phylogeography of the N3a haplogroup in Siberia.

Исследовали структуру генофонда коренного населения Республики Саха (Якутия). Охарактеризован состав и частоты гаплогрупп Y-хромосомы у якутов. Обнаружено шесть гаплогрупп: C3 ? M77, С3с, N*, N2, N3a и R1a1, из них наиболее часто встречается в якутской популяции гаплогруппа N3a (89%). Генное разнообразие, рассчитанное на основании частот гаплогрупп во всех исследованных выборках невелико. Оценка генетической дифференциации исследованных выборок при анализе молекулярной дисперсии (AMOVA) по двум системам маркеров (частотам гаплогрупп и микросателлитных гаплотипов Y-хромосомы) составляет 0.24 и 2.85% соответственно. Выявлены частоты и молекулярная филогения YSTR-гаплотипов в пределах гаплогруппы N3a Y-хромосомы. Всего у якутов найдено сорок гаплотипов. Эвенки и якуты характеризуются перекрывающимся и очень специфичным спектром гаплотипов N3a, не характерным для других сибирских этносов. Кластерный анализ популяций по YSTR-гаплотипам N3a свидетельствует об обособленности якутов от других тюркоязычных популяций Южной Сибири. Оценка времени генерации генетического разнообразия для специфического спектра гаплотипов якутов дает величины около 4.45 ± 1.96 тыс. лет. Эти результаты, в противоположность данным по мтДНК, свидетельствуют о значительном вкладе местного палеолитического компонента в Y-хромосомную составляющую генофонда якутов. Анализ разнообразия и филогеографии гаплогруппы N3a на территории Сибири позволяет реконструировать этногенез.

Association of different alleles of immune response modifier genes IL1B (+3953A1/A2), IL1RN (VNTR), IL4 (3'-UTR G/C), IL4RA (I50V), IL12B (1188A/C), and VDR (F/f and B/b) with celiac disease (CD) and its clinical forms was investigated in a family cohort of CD patients from the Tomsk region (N = 139, including 49 probands, i.e., affected children). The control group comprised 129 healthy Russians from Tomsk. A case-control study did not associate any of the polymorphic markers with CD. In a family-based study, the 3'-UTR G/C polymorphism of IL4 was associated with CD (P = 0.024), its atypical form (P = 0.001), and its complications such as osteopenia (P = 0.039) and autoimmune thyroiditis (P = 0.042). IL4RA and VDR polymorphisms I50V and F/f were associated with the typical form of CD (P = 0.001 and P = 0.009, respectively). In general, associations with CD phenotypes were shown primarily for polymorphisms of the genes involved in Th2 immunity.

На семейной выборке больных целиакией (n = 139, из них 49 пробандов – больные дети) из Томской области изучено влияние различных аллелей генов-модификаторов иммунного ответа IL1В (+3953А1/А2), IL1RN (VNTR), IL4 (3-UTR G/C), IL4RA (I50V), IL12B (1188A/C) и VDR (F/f и B/b) на развитие целиакии и вариантов ее клинического течения. Контрольная выборка составила 129 здоровых русских жителей Томска. Методом случай-контроль не обнаружено ассоциации ни одного из полиморфных вариантов с целиакией. В то же время на семейном материале обнаружена ассоциация с заболеванием полиморфизма 3-UTR G/C гена IL4 (p = 0.024). Выявлена ассоциация полиморфизма 3-UTR G/C с атипичной формой заболевания (p = 0.001), а также с остеопеническими осложнениями (p = 0.039) и аутоиммунным тиреоидитом (p = 0.042), наблюдаемыми при целиакии. Установлена связь полиморфизмов I50V гена IL4RA и F/f гена VDR с типичной формой заболевания (p = 0.001 и p = 0.009 соответственно). В целом показано, что с фенотипами целиакии связаны, главным образом, полиморфные варианты генов, ответственных за развитие Th2-иммунного ответа.

The IL4 C(−590)T, IL4RA Ile50Val, and TNF G(−308)A polymorphisms were tested for association with quantitative traits important for chronic virus hepatitis, including the levels of IL4, IL10, IL12, TNF-α, fibronectin, collagenase, the proteinase inhibitor, macroglobulin, and free and protein-bound (PBO) oxyproline. Allele A of the TNF G(−308)A polymorphism was associated with a lower TNF-α production by mononuclear cells, a higher production of IL4 and IL12, and a lower PBO level. The genotype CT of the IL4 C(−590)T polymorphism was associated with a high PBO level.

Изучена связь полиморфных вариантов C(-590)T гена IL4, Ile50Val гена IL4RA и G(-308)A гена TNF с такими значимыми для течения хронического вирусного гепатита количественными признаками, как уровень интерлейкинов 4, 10, 12, фактора некроза опухолей , фибронектина, коллагеназы, ингибитора протеиназ, макроглобулина, эластазы и фракций оксипролина – свободной и белковосвязанной. Показано, что аллель А полиморфного маркера G(-308)A гена TNF связан с более низкой продукцией фактора некроза опухолей мононуклеарными клетками, повышенным синтезом интерлейкинов 4 и 12 и с более низким уровнем оксипролина, связанного с белком. Выявлена связь генотипа СТ маркера C(-590)T гена IL4 с высоким уровнем оксипролина, связанного с белком.

The IL4 C(−590)T, IL4RA Ile50Val, and TNF G(−308)A polymorphisms were tested for association with the chronic development of virus hepatitis, the extent of which was inferred from the liver fibrosis stage. The frequency of allele A of the TNF G(−208)A polymorphism in patients with mild fibrosis was higher (24.5%) than in patients with moderate or severe fibrosis (13.4%) or cirrhosis (8.7%). The frequency of heterozygous genotype CT of the IL4 C(−590)T polymorphism significantly differed between cirrhosis (68.2%) and moderate or severe fibrosis (39.1%).

Изучена ассоциация полиморфных маркеров C(-590)T гена IL4, Ile50Val гена IL4RA и G(-308)A гена TNF со степенью хронизации вирусного гепатита, определяемой стадией фиброза печени. Показано, что частота аллеля А полиморфного маркера G(-308)A гена TNF в группе больных со слабой степенью фиброза выше (24.5%), чем в группе с умеренным и выраженным фиброзом (13.4%) и циррозом печени (8.7%). Частота гетерозиготного генотипа СТ полиморфного маркера C(-590)T гена IL4 в группе больных циррозом печени (68.2%) отличалась от частоты в группе с хроническим гепатитом с умеренным и выраженным фиброзом (39.1%).

Исследованы полиморфизмы 1342A/G в зкзоне 9 и длин тандемных повторов (VNTR) в 3 '-некодирующей области (З'-UTR) гена переносчика дофамина DATl (SLC6A3) в группах мужчин? больных алкоголизмом? из г. Томска (п=91) и контрольной группе здоровых мужчин, сходной с группой больных по возрасту и статусу курения (п=79). Показана статистически значимая ассоциация гетсро- и гомозиготности по аллелям не с 10копиями повтора VNTR в З'-UTR DAT1 с алкоголизмом (р=0,018; OR-2,11; 95% CI 1,08-4,16). Также выявлено протективпое действие гаплотипа «10 А» полиморфигиов VNTR в 3'- UTR и 1342 A/G в зкзоне 9 DATI для развития болезни (р=0,037; OR=0,63; 95% С10,39-1,00). В группах по обоим локусам выполняется равновесие Харди-Вайнберга. Коэффициент неравновесия по сцеплению (D')cocmaвил 0,4и 0,6в группах больных и контроля соответственно.