Публикации сотрудников

Просмотреть/скачать публикации сотрудников можно только авторизованным пользователям.

2007

Tamm E., Kivisild T., Reidla M., Metspalu M., Smith D. G., Mulligan C.,Bravi C. M., Rickards O., Martinez-Labarga C., Khusnutdinova E. K., Fedorova S. A., Golubenko M. V. // Plos ONE. 2007. 2(9), e829.
DOI: 10.1371/journal.pone.0000829

Native Americans derive from a small number of Asian founders who likely arrived to the Americas via Beringia. However, additional details about the initial colonization of the Americas remain unclear. To investigate the pioneering phase in the Americas we analyzed a total of 623 complete mtDNAs from the Americas and Asia, including 20 new complete mtDNAs from the Americas and seven from Asia. This sequence data was used to direct high-resolution genotyping from 20 American and 26 Asian populations. Here we describe more genetic diversity within the founder population than was previously reported. The newly resolved phylogenetic structure suggests that ancestors of Native Americans paused when they reached Beringia, during which time New World founder lineages differentiated from their Asian sister-clades. This pause in movement was followed by a swift migration southward that distributed the founder types all the way to South America. The data also suggest more recent bi-directional gene flow between Siberia and the North American Arctic.

Читать в источнике

Varzari A., Stephan W., Stepanov V., Raicu F., Cojocaru R., Roschin Y., Glavce C., Dergachev V., Spiridonova M., Schmidt H., Weiss E.
Journal of Human Genetics. 2007. 52(4), 308-316.
DOI: 10.1007/s10038-007-0113-x

The area between the Dniester and the eastern Carpathian mountain range is at a geographical crossroads between eastern Europe and the Balkans. Little is known about the genetics of the population of this region. We performed an analysis of 12 binary autosomal markers in samples from six Dniester-Carpathian populations: two Moldavian, one Romanian, one Ukrainian and two Gagauz populations. The results were compared with gene frequency data from culturally and linguistically related populations from Southeast Europe and Central Asia. Small genetic differences were found among southeastern European populations (in particular those of the Dniester-Carpathian region). The observed homogeneity suggests either a very recent common ancestry of all southeastern European populations or strong gene flow between them. Despite this low level of differentiation, tree reconstruction and principle component analyses allowed a distinction between Balkan-Carpathian (Macedonians, Romanians, Moldavians, Ukrainians and Gagauzes) and eastern Mediterranean (Turks, Greeks and Albanians) population groups. The genetic affinities among Dniester-Carpathian and southeastern European populations do not reflect their linguistic relationships. The results indicate that the ethnic and genetic differentiations occurred in these regions to a considerable extent independently of each other. In particular, Gagauzes, a Turkic-speaking population, show closer affinities to their geographical neighbors than to other Turkic populations.

Читать в источнике

Ogorodova L.M., Freidin M.B., Sazonov A.E., Fedorova O.S., Gerbek I.E., Cherevko N.A., Lebedeva E.Yu.
Parasitology Research. 2007. 101(4), 1165-1168.
DOI: 10.1007/s00436-007-0588-6

The study was aimed to estimate the relationship between the prevalence of allergic disease and helminth invasion by the trematode Opisthorchis felineus in rural and urban populations of Tomsk Oblast (West Siberia, Russia). Two hundred and one people from Kargasok village of Tomsk Oblast and 196 from the city of Tomsk were screened for the presence of atopy and O. felineus invasion. Opisthorchosis was found in 66 participants (32.8%) from Kargasok and in 22 people (11.2%) from Tomsk. Atopic diseases were more common in the urban population than in the rural: 52.8 and 31.4%, respectively. Positive skin-prick tests were significantly higher in the urban population than in rural people: 83.2 vs 24.4%, respectively. It was found that in the city, the presence of antibodies to O. felineus negatively correlates with the atopic sensitization by skin-prick tests. However, in the village, opisthorchosis was positively associated with atopic diseases. The data obtained confirm the negative association of rural lifestyle and atopic diseases prevalence and indicate that O. felineus invasion might be a modifying factor of this relationship in Tomsk Oblast.

Читать в источнике

2006

Кашеварова А.А., Саженова Е.А., Лебедев И.Н., Назаренко С.А.
Бюллетень СО РАМН. 2006. № 1. С. 101-105.
Проведено исследование вклада явлений потери импринтинга и гиперметилирования промоторного региона импринтированного гена SNRРN в этиологию ранней эмбриональной летальности у человека. С помощью метилспецифичной полимеразной цепной реакции обследовано 40 эмбрионов человека с цитогенетически установленным нормальным кариотипом, внутриутробная гибель которых была подтверждена с использованием ультразвуковой диагностики беременных женщин. В качестве контрольной группы изучены 8 медицинских абортусов с нормальным кариотипом. Ни у одного из обследованных зародышей не выявлено изменений статуса метилирования гена SNRРN. Полученные данные свидетельствуют об отсутствии заметного вклада эпигенетических модификаций промоторного региона SNRРN в этиологию ранней эмбриональной гибели у человека.
Читать в источнике

Голубенко М.В., Пузырев К.В., Макеева О.А.
Медицинская генетика. 2006. Т.5. Прил. 2. С. 20-28.

Васьковский Н.В., Серебров В.Ю., Фрейдин М.Б., Огородова Л.М., Петровский Ф.И., Деев И.А.
Медицинская генетика. 2006. № 2. С. 45-48.
Обнаружено 6 однонуклеотидных замен в нуклестидных позициях 46, 79, 00, 235, 252. 396 от начала кодирующей части гена ADRB2. Замена 396С>Т в кодирующей части гена ADRB2 обнаружена и описана впервые, Аллель 46G гена ADRB2 ассоциирован с атопической бронхиальной астмой (БА). Не выявлено ассоциации с БА замены 79C>G в кодирующей части гена ADRB2.
Читать в источнике

Пузырев В.П., Макеева О.А., Голубенко М.В.
Информационный вестник ВОГиС. 2006. Т. 10. № 3. С. 479-491.

Опыт изучения в постгеномный период генетики сложно наследуемых признаков, к которым относятся и широко распространенные заболевания человека, свидетельствует о том, что феном, а не геном является главной проблемой в генетических исследованиях их природы. Эту трудность (противоречие) предвидел в начале ХХ в. отечественный генетик А.С. Серебровский, сформулировавший положение о единстве бесконечного числа признаков и конечного числа генов, вошедшее имплицитно в разработку современных программ феномных исследований широко распространенных заболеваний. Ранее, во второй половине XIX в., французский клиницист Ш. Бушар обратил внимание на часто встречающийся феномен сочетания определенных болезней у индивида и его родственников, в последующем обозначенных как синтропии - сочетания у одного индивида клинически различных болезней с общим патогенезом. Высказано предположение, что синтропии есть природно-видовое явление, неслучайное и имеющее под собой эволюционно-генетическую основу. В статье обосновывается, что выборка из бесконечного числа признаков фенома человека, составляющая суть отдельных синтропий, однородных по механизмам формирования совокупностей признаков, параметров, болезней и факторов риска, может быть оптимальным объектом поиска для них общих генетических детерминант, названных нами «генами синтропий» («синтропные гены»). Приводятся результаты исследования таких генов для одной из синтропий - болезней сердечно-сосудистого континуума.

Читать в источнике

Воевода М.И., Степанов В.А., Ромащенко А.Г., Максимов В.Н.
Бюллетень Сибирского отделения Российской академии медицинских наук. 2006. Т. 26. № 2. С. 63-72.

Анализ полиморфизма генов играет важную роль в оценке предрасположенности к мультифакториальным заболеваниям на популяционном и индивидуальном уровне. В настоящей работе было проведено определение частот аллельных вариантов гена аполипопротеина Е и соответствующих генотипов у представителей различных этнических групп Сибири: коренных жителей Чукотского автономного округа, Северного Алтая, Горной Шории, Ханты-Мансийского автономного округа, Хакасии и в европеоидной популяции жителей г. Новосибирска. Для изученных популяций была выявлена связь полиморфизма гена аполипопротеина Е с некоторыми хроническими неинфекционными заболеваниями и их факторами риска.

Читать в источнике

Огородова Л.М., Фрейдин М.Б., Сазонов А.Э., Федорова О.С., Гербек И.Э., Черевко Н.А., Рудко А.А., Брагина Е.Ю., Перевозчикова Т.В., Файт Е.А., Лебедева Н.Ю.
Бюллетень сибирской медицины (Томск). 2006. Т. 5. № 4. С. 48-51.

Цель исследования - оценка эпидемиологической и патогенетической взаимосвязи аллергических заболеваний и описторхозной инвазии у жителей Томской области. Исследование распространенности описторхоза и аллергической патологии у населения г. Томска и Томской области проведено методом сплошного одномоментного исследования на двух выборках, отобранных случайным образом: выборке сельских (201 человек, средний возраст (12,1 ± 3,4) года) и городских жителей (196 человек, средний возраст (30,16 ± 12,86) года). В рамках программы использовались клинические, эпидемиологические, паразитологические, аллергологические, иммунологические и статистические методы. Установлено, что у сельских жителей, страдающих описторхозом, распространенность аллергопатологии вдвое выше, чем среди неинвазированных представителей этой выборки (40,9 и 26,1% соответственно; р < 0,05). У пациентов городской выборки эта диспропорция менее выражена: 54,5 и 52,6% соответственно.

Читать в источнике

Пузырев К.В., Павлюкова Е.Н., Кошельская О.А., Макеева О.А., Голубенко М.В., Косянкова Т.В., Пузырев В.П., Карпов Р.С. Атрошенков А.В., Ефимова Е.В.
Сибирский медицинский журнал (Томск). 2006. Т. 21. № 4. С. 39-43.

Артериальная гипертензия - мультифакториальное заболеванием со сложными взаимодействиями многочисленных генетических и средовых факторов. В связи с существованием большого числа генов подверженности к АГ, в мире широко проводятся исследования по идентификации конкретных генов, которые могут влиять на регуляцию уровня АД. Ансамбль полиморфных вариантов генов-кандидатов способен модулировать экспрессию ключевых генов и определять клинический полиморфизм заболевания. В исследовании изучена роль полиморфных вариантов гена ангиотензиногена (AGT, полиморфизм Т174М), сосудистого рецептора первого типа ангиотензина II (AGTR1, полиморфизм А1166С) ангиотензин-I конвертирующего фермента (АСЕ, полиморфизмы I/D и A2350G), bЗ субъединицы G-белка (GNB3, полиморфизм С825Т), эндотелиальной синтазы оксида азота (NOS3, полиморфизмы С774Т и VNTR) в формировании уровня АД, оцененного методом 24-часового мониторирования. На основе представленных клинико-генетических ассоциаций, возможно выделение групп больных с риском поражения органов-мишеней.

Читать в источнике

Спиридонова М.Г., Трифонова Е.А., Фадюшина С.В., Минайчева Л.И., Назаренко Л.П., Соколова Т.Ю., Агаркова Л.А., Дикке Г.Б., Габитова Н.А., Федоренко О.А.
Сибирский медицинский журнал (Томск). 2006. Т. 21. № 5. С. 17-18.
Читать в источнике

Рудко А.А., Фрейдин М.Б., Ондар Э.А., Колоколова О.В., Стрелис А.К., Пузырёв В.П.
Сибирский консилиум. 2006. № 3-4.

Буйкин С.В., Голубенко М.В., Пузырев В.П.
Сибирский консилиум. 2006. №2 (49). С. 48-53.

Гончарова И.А., Фрейдин М.Б., Рудко А.А., Напалкова О.В., Колоколова О.В., Ондар Э.А., Дунаева Л.Е., Белобородова Е.В., Пузырев В.П.
Информационный вестник ВОГиС. 2006. Т. 10. № 3. С. 540-552.

В статье представлено обобщение современных знаний о наследственных основах подверженности к таким инфекционным заболеваниям, как туберкулез, сальмонеллез, клещевой энцефалит, болезнь Лайма, вирусные гепатиты. На материале результатов собственных исследований и данных литературы показана важная роль изменчивости генома человека в формировании в популяциях групп лиц, подверженных и устойчивых к инфекционным заболеваниям. Высказывается точка зрения об общей наследственной основе предрасположенности к разным инфекционным патологиям, обусловленной общностью механизмов противоинфекционного иммунитета. Обсуждаются теоретические и практические перспективы исследований геномных основ подверженности к инфекционным болезням.

Читать в источнике

Лебедев И.Н., Никитина Т.В., Токарева А.Г., Суханова Н.Н., Назаренко С.А.
Информационный вестник ВОГиС. 2006. Т. 10. № 3. С. 520-530.

Для онтогенеза человека характерна чрезвычайно высокая частота репродуктивных потерь, в значительной степени обусловленная геномными мутациями. Несмотря на интенсивные исследования структуры хромосомного дисбаланса, ассоциированного с патологией эмбриогенеза, многие вопросы о механизмах формирования высокого уровня нарушений кариотипа на самых ранних этапах индивидуального развития до сих пор остаются неясными. С развитием методов полногеномного молекулярно-цитогенетического анализа и вспомогательных репродуктивных технологий накапливаются данные о значительной доле мозаичных форм хромосомных аномалий в структуре геномных мутаций у зародышей человека. Наличие в организме двух или более клеточных клонов с разными хромосомными наборами свидетельствует о митотической нестабильности эмбрионального генома. Другим маркером нестабильности выступают соматические мутации микросателлитных локусов ДНК, частота которых, в отличие от мутаций гаметического происхождения, заметно повышена у внутриутробно погибших зародышей человека. По-видимому, нестабильность генома на разных уровнях его организации является одним из основных факторов пренатального отбора у человека. В обзоре рассмотрены данные о некоторых патогенетических эффектах геномной нестабильности в эмбриональном развитии организма. Обсуждается гипотеза о взаимосвязи высокого уровня мутационной изменчивости с нарушениями фундаментальных механизмов эпигенетической регуляции ранних этапов онтогенеза.

Читать в источнике

1 ... 23 24 25 26 27 ... 49