Область научных интересов Колесникова Н.А. касается фундаментальных направлений популяционной и эволюционной генетики человека, эволюции генофондов и механизмов генетической адаптации популяций человека, вопросов ДНК-идентификации индивида, исследования человека в контексте орфанных и многофакторных заболеваний. В его текущих исследованиях основное внимание уделяется изучению генетической структуры популяций коренного населения Сибири на основе анализа идентичных по происхождению блоков (IBD) и регионов высокой гомозиготности (ROH).

Колесников Н.А. участвует в проведении научных исследований при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований, Российского научного фонда, Федеральных целевых программ.

1. Степанов В.А., Харьков В.Н., Вагайцева К.В., Хитринская И. Ю., Бочарова А.В., Колесников Н.А., Зарубин А.А., Попович А.А., Марусин А.В., Спиридонова М.Г., Триска П., Татаринова Т.В. Сигналы направленного отбора в популяциях народов Сибири и европейской части России. Генетика. Том: 55 Номер: 10 Год: 2019 Страницы: 1198–1207

2. Колесников Н.А., Харьков В.Н., Зарубин А.А., Степанов В.А. Особенности распределения регионов высокой гомозиготности в геномах представителей коренного населения Северной Евразии. Генетика. Том: 55 Номер: 10 Год: 2019 Страницы: 1231–1236

3. Колесников Н.А., Харьков В.Н., Раджабов М.О., Зарубин А.А., Литвинов С.С., Екомасова Н.В., Хуснутдинова Э.К., Степанов В.А. Различия по уровню инбридинга в популяциях Дагестана: анализ регионов высокой гомозиготности. Медицинская генетика. Том 19. Номер: 7. Год: 2020 Страницы: 21–22

4. Malakhova A.A., Grigor'eva E.V., Vasilyeva O.Y., Zhigalina D.I., Skryabin N.A., Sivtcev A.A., Kolesnikov N.A., Bueverov A.O., Lebedev I. N., Bogomolov P.O., Zakian S.M. Generation of two induced pluripotent stem cell lines from peripheral blood mononuclear cells of a patient with Wilson’s disease. Stem Cell Research. 2020, 47(101922). doi: 10.1016/j.scr.2020.101922

5. Zarubin A., Stepanov V., Markov A., Kolesnikov N., Marusin A., Khitrinskaya I., Swarovskaya M., Litvinov S., Ekomasova N., Dzhaubermezov M., Maksimova N., Sukhomyasova A., Shtygasheva O., Khusnutdinova E., Radzhabov M., Kharkov V.. Structural Variability, Expression Profile, and Pharmacogenetic Properties of TMPRSS2 Gene as a Potential Target for COVID-19 Therapy. Genes 2021, 12(1), 19; https://doi.org/10.3390/genes12010019

6. Sazhenova E.A.; Nikitina T.V.; Vasilyev S.A.; Tolmacheva E.N.; Vasilyeva O.Y.; Markov A. V.; Yuryev S.Y.; Skryabin N.A.; Zarubin A.A.; Kolesnikov N.A.; Stepanov V.A.; Lebedev I. N.. NLRP7 variants in spontaneous abortions with multilocus imprinting disturbances from women with recurrent pregnancy loss. J Assist Reprod Genet 2021, doi: 10.1007/s10815-021-02312-z

7. Колесников Н. А., Харьков В. Н., Зарубин А. А., Раджабов М. О., Воевода М. И., Губина М. А., Хуснутдинова Э. К., Литвинов С. С., Екомасова Н. В., Штыгашева О. В., Максимова Н. Р., Сухомясова А. Л., Степанов В. А.. Особенности геномного распределения регионов высокой гомозиготности у коренного населения Северной Евразии на индивидуальном и популяционном уровнях на основе анализа SNP высокойплотности. Генетика. 2021, том 57, № 11, с. 1261–1275

8. Харьков В.Н., Котова С.А., Колесников Н.А., Спивак Е.А., Вагайцева К.В., Забавская Т.В., Рыбакова В.И., Парфенова А.С., Верчук А.Н., Янковский Н.К., Степанов В.А. Генетическое разнообразие 21 аутосомного STR-маркера системы CODIS в популяциях Восточной Европы // Генетика. – 2021. – Т. 57. – № 12. – С. 1396-1402. – DOI 10.31857/S0016675821120055

9. Колесникова С.Ю., Харьков В.Н., Валихова Л.В. К вопросу об этногенезе енисейцев // Вестник ТГУ. История. 2022. № 79. С. 164-171. DOI: 10.17223/19988613/79/20

10. Харьков В.Н., Валихова Л.В., Яковлева Е.Л., Сереброва В.Н., Колесников Н.А., Петелина Т.И., Хитринская И.Ю., Степанов В.А. Реконструкция происхождения гыданских ненцев на основе генетического анализа их родовой структуры с помощью нового набора YSTR-маркеров // Генетика. – 2021. – Т. 57. – № 12. – С. 1403-1414. – DOI 10.31857/S0016675821120067

11. Колесников Н.А., Харьков В.Н., Зарубин А.А., Воевода М.И., Губина М.А., Штыгашева О.В., Максимова Н.Р., Сухомясова А.Л., Степанов В.А. Сигналы направленного отбора в популяциях коренного населения Сибири // Генетика. 2022. Т. 58. № 4. С. 470-474. DOI: 10.31857/S0016675822040075

12. Валихова Л.В., Харьков В.Н., Зарубин А.А., Колесников Н.А., Сваровская М.Г., Хитринская И.Ю., Штыгашева О.В., Волков В.Г., Степанов В.А. Генетическая взаимосвязь чулымских тюрков с хакасами и кетами по данным аутосомных SNP и гаплогруппам Y-хромосомы // Генетика. 2022. Т. 58. № 10. С. 1177-1184. DOI: 10.31857/S0016675822100113

13. Zhalsanova I.Zh., Postrigan A.E. , Valiakhmetov N.R., Kolesnikov N.A. , Zhigalina D.I., Zarubin A.A., Petrova V.V., Minaycheva L.I., Seitova G.N., Skryabin N.A., Stepanov V.A. Case Report: A Novel Homozygous Variant of the SERPINF1 Gene in Rare Osteogenesis Imperfecta Type VI //  International Journal of Molecular Sciences. 2023. 24(7), 6672. DOI: 10.3390/ijms24076672

14. Степанов В.А., Колесников Н.А.,  Валихова Л.В., Зарубин  А.А., Хитринская И.Ю., Харьков В.Н. Структура и происхождение генофонда тувинцев по данным аутосомных SNP и гаплогрупп Y-хромосомы // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2023. Т. 27. № 1. С. 36-45. DOI: 10.18699/VJGB-23-06 06 (Stepanov V.A., Kolesnikov N.A., Valikhova  L.V., Zarubin  A.A., Khitrinskaya I.Yu.,  Kharkov V.N. Structure and origin of Tuvan gene pool according to autosome SNP and Y-chromosome haplogroups //  Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2023. 27(1), 36-45. DOI: 10.18699/VJGB-23-06 06)

15. Харьков В.Н., Колесников Н.А., Валихова Л.В., Зарубин  А.А., Сваровская М.Г.,  Марусин А.В., Хитринская И.Ю., Степанов В.А. Связь генофонда хантов с народами Западной Сибири, Предуралья и Алтая-Саян по данным о полиморфизме аутосомных локусов и Y-хромосомы // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2023. Т. 27. № 1. С. 46-54. DOI: 10.18699/VJGB-23-07 (Kharkov V.N., Kolesnikov N.A., Valikhova L.V., Zarubin A.A., Svarovskaya M.G., Marusin A.V., Khitrinskaya I.Yu., Stepanov V.A. Relationship of the gene pool of the Khants with the peoples of Western Siberia, Cis-Urals and the Altai-Sayan Region according to the data on the polymorphism of autosomic locus and the Y-chromosome //  Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2023. 27(1), 46-54.  DOI: 10.18699/VJGB-23-07)

16. Колесников Н.А., Харьков В.Н., Вагайцева К.В., Зарубин А.А., Степанов В.А. Идентичные по происхождению блоки в геномах коренного населения Сибири демонстрируют генетические связи между популяциями // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2023. Т. 27. № 1. С. 55-62. DOI: 10.18699/VJGB-23-08 (Kolesnikov N.A.,  Kharkov V.N., Vagaitseva K.V., Zarubin A.A., Stepanov V.A. Blocks identical by descent in the genomes of the indigenous population of Siberia demonstrate genetic links between populations //  Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2023. 27(1), 55-62. DOI: 10.18699/VJGB-23-08)