Научные интересы затрагивают эпигенетическую регуляцию генов при сердечно-сосудистых и митохондриальных заболеваниях. Основной научной темой в настоящее время является исследование вклада эпигенетических факторов (уровня метилирования ДНК и некодирующих РНК, в особенности микроРНК) в развитие атеросклеротического поражения артерий человека и его последствий.

В настоящее время Королёва Ю.А. участвует в качестве исполнителя в гранте Российского научного фонда (РНФ) № 22-25-00701 «Профиль метилирования ДНК в клетках сосудов коморбидности аневризмы грудной аорты и атеросклероза артерий различной локализации» (2022-2023 гг.); с 2012 по 2022 г. принимала участие в качестве исполнителя в выполнении работ по грантовым проектам РФФИ, РНФ, ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России», а также по Гранту Президента Российской Федерации для государственной поддержки ведущих научных школ Российской Федерации.

Королёва Ю.А. является лауреатом конкурсов молодых учёных, проведённых в рамках научных конференций: I место в конкурсе стендовых докладов на XI научной конференции «Генетика человека и патология» посвящённой 35-летию НИИ медицинской генетики (ноябрь 2017); 2 диплома III степени за доклады на Первом и Втором всероссийском научно-образовательном форуме с международным участием «Кардиология XXI века: альянсы и потенциал» (апрель 2018, апрель 2021).

На октябрь 2022 г. Королёва Ю.А. является автором и соавтором более 60 публикаций в отечественной и зарубежной печати. Из них в РИНЦ зарегистрировано 50 публикаций, 30 — индексируются в системах Web of Science и/или Scopus. Индекс Хирша равен 5 в базах данных РИНЦ и Scopus, 4 — в базе данных Web of Science,

Основные публикации за 5 лет

1. Назаренко М.С., Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Слепцов А.А. Регулом микроРНК при различных фенотипах атеросклероза // Молекулярная биология. – 2022. – Т. 56. – № 2. – С. 227-243. – DOI 10.31857/S0026898422020136. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=47957950 (Nazarenko M.S., Koroleva Yu.A., Zarubin A.A., Sleptsov A.A. miRNA Regulome in Different Atherosclerosis Phenotypes // Molecular Biology. – 2022. – Vol. 56. – No 2. – P. 166-181. – DOI 10.1134/S0026893322020108 Режим доступа: https://link.springer.com/article/10.1134/S0026893322020108)

2. Кучер А.Н., Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Назаренко М.С. МикроРНК как потенциальные регуляторы инфицирования SARS-CоV-2 и модификаторы клинической картины COVID-19 // Молекулярная биология. – 2022. – Т. 56. – № 1. – С. 35-54. – DOI 10.31857/S0026898422010049. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=47696366 (Kucher A.N., Koroleva I.A., Zarubin A.A., Nazarenko M.S. MicroRNAs as the Potential Regulators of SARS-CoV-2 Infection and Modifiers of the COVID-19 Clinical Features // Molecular Biology. – 2022. – Vol. 56. – No 1. – P. 29-45. – DOI 10.1134/S0026893322010034 Режим доступа: https://link.springer.com/article/10.1134/S0026893322010034 )

3. Гончарова И.А., Королева Ю.А., Слепцов А.А., Бабушкина Н.П., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Назаренко М.С. Связь локуса 17q23.1 с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий // Медицинская генетика. – 2021. – Т. 20. – № 10(231). – С. 25-32. – DOI 10.25557/2073-7998.2021.10.25-32. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=47365533

4. Королёва Ю.А., Марков А.В., Гончарова И.А., Слепцов А.А., Бабушкина Н.П., Валиахметов Н.Р., Шарыш Д.В., Зарубин А.А., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Назаренко М.С. Метилирование дезоксирибонуклеиновой кислоты в области энхансера генов CDKN2A/2b и CDKN2B-AS1 в сосудах и клетках крови у пациентов с атеросклерозом сонных артерий // Российский кардиологический журнал. – 2020. – Т. 25. – № 10. – С. 32-40. – DOI 10.15829/1560-4071-2020-4060. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=44193170

5. Королёва Ю.А., Марков А.В., Слепцов А.А., Зарубин А.А., Муслимова Э.Ф., Афанасьев С.А., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Назаренко М.С. Анализ уровня метилирования гена MIR21 в сосудах и лейкоцитах крови при атеросклерозе сонных артерий методом таргетного бисульфитного секвенирования // Медицинская генетика. — 2020. — Т. 19, № 5 (214). — С. 41—43. DOI 10.25557/2073-7998.2020.05.41-43. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=44061488

6. Марков А.В., Бабушкина Н.П., Голубенко М.В., Салахов Р.Р., Зарубин А.А., Слепцов А.А., Королёва Ю.А., Шарыш Д.В., Муслимова Э.Ф., Афанасьев С.А., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Назаренко М.С. Особенности метилирования CpG-сайтов в области гена микроРНК MIR10B и гена транскрипционного фактора TWIST1 при атеросклерозе // Медицинская генетика. – 2020. – Т. 19. – № 5(214). – С. 44-45. – DOI 10.25557/2073-7998.2020.05.44-45. Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=44061489

7. Королёва Ю.А., Назаренко М.С., Кучер А.Н. Роль микроРНК в формировании нестабильности атеросклетической бляшки // Биохимия. – 2018. – Т. 83. – № 1. – С. 34-46. Режим доступа: https://elibrary.ru/item.asp?id=32247024 (Koroleva I.A., Nazarenko M.S., Kucher A.N. Role of microRNA in development of instability of atherosclerotic plaques //Biochemistry (Moscow). – 2017. – V. 82. – N. 11. – P. 1380-1390. DOI: 10.1134/S0006297917110165 Режим доступа: https://link.springer.com/article/10.1134/S0006297917110165)

8. Королёва Ю.А., Зарубин А.А., Марков А.В., Казанцев А.Н., Барбараш О.Л., Назаренко М.С. Анализ связи уровня метилирования генов MIR10B и MIR21 в лейкоцитах крови с клинически выраженным атеросклерозом сонных артерий // Сибирский медицинский журнал. – 2018. – Т. 33. – № 2. – С. 77-82. DOI: 10.29001/2073-8552-2018-33-2-77-82. Режим доступа: https://elibrary.ru/item.asp?id=35296169

9. Назаренко М.С., Марков А.В., Слепцов А.А., Королёва Ю.А., Шарыш Д.В., Зарубин А.А., Валиахметов Н.Р., Гончарова И.А., Муслимова Э.Ф., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Афанасьев С.А., Пузырёв В.П. Сравнительный анализ экспрессии генов в клетках сосудов у больных с клинически выраженным атеросклерозом // Биомедицинская химия. – 2018. – Т. 64. – №. 5. – С. 416-422. DOI: 10.18097/PBMC20186405416.
   Режим доступа: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=36321124 (Nazarenko M.S., Markov A.V., Sleptcov A.A., Koroleva I.A., Sharysh D.V., Zarubin A.A., Valiahmetov N.R., Goncharova I.A., Muslimova E.F., Kuznetsov M.S., Kozlov B.N., Afanasiev S.A., Puzyrev V.P. Comparative Analysis of Gene Expression in Vascular Cells of Patients with Advanced Atherosclerosis // Biochemistry (Moscow), Supplement Series B: Biomedical Chemistry. – 2019. – Vol. 13. – N. 1. – P. 74-80. DOI: 10.1134/S1990750819010104. Режим доступа: