В обзоре обобщены современные знания о генетических основах подверженности таким инфекционным болезням, как туберкулез, сальмонеллез, клещевой энцефалит, болезнь Лайма, вирусные гепатиты. На материале результатов собственных исследований и данных литературы показана важная роль изменчивости генома человека в формировании в популяциях групп лиц, подверженных и устойчивых к инфекционным заболеваниям. Высказывается точка зрения на общую генетическую основу предрасположенности к разным инфекционным патологиям, обусловленной общностью механизмов противоинфекционного иммунитета. Обсуждаются теоретические и практические перспективы исследований геномных основ подверженности к инфекционным болезням.

Представлены данные по оценке связи однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) генов SLC11A1, VDR, IL12B, /LIB и полиморфизма по 86 п.н. мини-сателлитному повтору гена ILJRA с туберкулезом (ТБ) у тувинцев и русских с помощью Transmission/Disequilibrium Test(TDT). При обследовании 129 семей тувинцев показана связь с заболеванием аллелей SLC11A1*469+14G, SLCUA1*1465-85G, SLC11A1*543D, IL12B4188A. Эти данные не согласуются с результатами ранее проведенного популяционного исследования генетической компоненты подверженности ТБ у тувинцев. В то же время при исследовании 42 семей русских подтверждена установленная ранее ассоциация с ТБ аллеля 1L12В*1188С.

Представлены результаты повторного эпидемиологического исследования моногенной наследственной патологии в Томской области. Выявлено 953 семьи с 1236 больными. Получены данные об отягощенности наследственной патологией популяции Томской области: аутосомно-доминантной (АД) патологией - 0,71±0,06, аутосомно-рецессивной (АР) - 0,64±0,05, Х-сцепленной (Х-си) - 0,32±0,03. Уровень отягощенности городского населения в Томской области статистически значимо выше сельского по отягощенности АД и АР патологией. Описаны спектр наследственной патологии и его особенности.

Обнаружение ДНК плода в плазме беременных женщин послужило стимулом к разработке новых подходов для осуществления неинвазивной пренатальной диагностики. Предполагается, что главным источником такой ДНК являются клетки плаценты. Показано, что фетальная ДНК в крови матери может служить источником биологического материала для определения пола плода, его RhD-cmamyca, заболеваний, сцепленных с полом, и других наследственных болезней. Повышение концентрации феталъной ДНК имеет место при некоторых осложнениях течения беременности, таких, как преждевременные роды и преэклампсия, а также в случае вынашивания плода с синдромом Дауна. РНК плода, также циркулирующая в материнской крови, является еще одним новым потенциальным маркером для выявления нарушений его развития. В настоящем обзоре рассматриваются вопросы о происхождении внеклеточных нуклеиновых кислот плода в кровотоке матери и возможностях их применения для неинвазивной пренатальной диагностики

Проведено сравнительное исследование комплекса фенотипических признаков у пациентов с клинической картиной синдрома Прадера-Вилли (СПВ), дифференцированных на группы по результатам молекулярно-ге-нетической диагностики: имеющих делецию 15q 11-q13 на отцовском гомологе, однородительскую дисомию хромосомы 15 материнского происхождения либо характерные для данного заболевания признаки, не сопровождающиеся молекулярными изменениями в центре импринтинга. Анализ соответствий показал, что 3группы индивидов различаются между собой по клинической картине заболевания (р=0,01). На фоне основных диагностических критериев группа пациентов с однородительской дисомией статистически значимо отлича лась от других групп по частоте регистрации диастемы и гипоплазии зрительного нерва, а пробанды с делецией демонстрировали более высокую частоту встречаемости гидроцефалии. Высокий рост, дефект межжелудоч ковой или межпредсердной перегородки, микростомия, микроцефалия и эпикант дифференцировали группу па циентов без молекулярных нарушений. Кроме того, эти индивиды отличались меньшей частотой встречаемости задержки речевого развития, нанизма, акромикрии, булимии и гипотиреоза. Анализ совокупно сти клинических признаков может иметь значимость для дифференциальной диагностики СП В и определения стратегии молекулярно-генетического анализа.

Изучено распределение аллелей и генотипов двух генов алкогольдегидрогеназ ADH1B (полиморфизм A/G (Arg47His; -/+Msl I; А1/А2) в 3 экзоне), ADH7 (полиморфизм G/C (+/- Sty I; В1/В2) в 5 интроне ) и гена цитохром Р450 2Е1 (CYP2E1, полиморфизмы G/C (-/+PstI; С1/С2) в 5’-UTR и Т/А (+/-Dra I; D/C) в 6 интроне) в выборках двух городских и сельской популяций. В изученных популяциях частоты генотипов удовлетворяют равновесию Харди-Вайнберга, а по частотам аллелей не обнаружено межпопуляционных и половых отличий, поэтому все три выборки составили общую группу популяционного контроля. В общей выборке для частот аллелей 4 генов выполняется равновесие по сцеплению (или гаметическое равновесие) по сочетаниям пар генов, за исключением полиморфизмов гена CYP2E1, которые сцеплены. В общей выборке «мутантные» (производные) аллели ADH1B*A2 (+Msl I), CYP2E1*C2 (+Pst I) и CYP2E1*С (-Dra I) встречаются с низкой частотой (0,0627; 0,0276 и 0,0877 соответственно). Полиморфизм гена ADH7 характеризуется высоким уровнем генетической изменчивости, частота аллеля ADH7*B2 (-Sty I) составила 0,4649. Частоты «мутантных» аллелей в группе больных (г. Томск) равны 0,0176; 0,5471; 0,0176 и 0,0647 для ADH1B*A2, ADH7*B2, CYP2E1*C2 и CYP2E1*С, соответственно. Обнаружена ассоциация аллелей алкогольдегидрогеназы ADH1B с риском развития алкоголизма коморбидного с туберкулёзом. Отношение шансов (OR) развития алкоголизма у больных туберкулёзом для носителей аллеля ADH1B*A2 составило 0,27 (95 % CI 0,07 – 0,91; P=0,015). Для носителей аллеля ADH7*B2 OR было близко к статистически значимому – 1,39 (95 % CI 0,98 – 1,96; P=0,052). Также выявлена гетерогенность частот гаплотипов ADH1B и ADH7 (Р=0,012), частота гаплотипа ADH1B*A1_ ADH7*B2 на 10 % выше в группе больных (Р=0,017).

У J50 здоровых детей ЗА ТО Северск 7-11 лет изучена ассоциация количественных морфофизиологических признаков (рост, вес, индекс массы тела), уровни тиреотропных и тиредидных гормонов (ТТГ и T4), объем и размеры долей щитовидной железы (ЩЖ) с полиморфными вариантами генов, белковые продукты которых во- влечены в синтез и метаболизм тиреоидных гормонов: TPO,DIO,TSHR.Показана статистически значимая отрицательная корреляция между уровнем Т4 и ростом, объемом щитовидной железы (р<0,05). Уровень ТТГ коррелировал с ростом и весом (р<0,01), связь уровней гормонов с полом отсутствовала (р>0,05). Установлена статистически значимая связь полиморфизма 1201 A/G гена ТРО с ростом и полиморфизма 206,G/C гена TSHR с уровнем физического развития (р<0,05), оцененного по росту и весу

Полиморфизм гена β2--адренорецептора ( 2-АР) может быть важным фактором предрасположенности к бронхиальной астме (БА) и оказывать влияние на эффективность терапии β-агонистами. В настоящее время нет единого мнения о том, какие именно изоформы β2-АР играют ведущую роль в развитии заболевания. Считается, что на функцию β2-АР определенное влияние может оказывать присутствие глицина в 16 и глутами-на в 27 аминокислотных позициях.

Experiments have demonstrated that some mitochondrial malfunctions [4] and embryonic abnormalities [5] are typical of mice knocked out in POLG, implicating the gene in embryogenesis. According to the NCBI SNP database (www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP), 161 single nucleotide polymorphisms (SNPs) have been described for this gene.

Эксперименты показали, что некоторые митохондриальные нарушения [4] и эмбриональные аномалии [5] типичны для мышей, нокаутированных в POLG, что указывает на участие гена в эмбриогенез. Согласно базе данных NCBI SNP (www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/SNP), 161 сингл были описаны нуклеотидные полиморфизмы (SNP) для этого гена.

Polymorphisms of the tuberculosis (TB) susceptibility genes SLC11A1, VDR, IL12B, IL1B, and IL1RN were studied, for the first time in Russia, in Tuvinians from the Tyva Republic and ethnic Russians from Tomsk. Compared with Russians, Tuvinians had significantly higher frequencies of potentially pathological alleles SLC11A1*543N (0.139 vs. 0.043, P = 4.6 · 10−5), IL12B*1188C (0.378 vs. 0.174, P = 1.1 · 10−8), VDR*b (0.825 vs. 0.532, P = 3.2 · 10−16), IL1B*(+3953A1) (0.865 vs. 0.806, P = 0.035), and IL1RN*A1 (0.849 vs. 0.786, P = 0.030). However, none of the alleles was associated with TB in Tuvinians. Compared with healthy subjects, Russian patients with TB had higher frequencies of alleles IL1RN*A2 (0.258 vs. 0.186, P = 0.024), SLC11A1*274T (0.251 vs. 0.164, P = 0.009), IL12B*1188C (0.240 vs. 0.174, P = 0.044), and IL1B*(+3953A2) (0.259 vs. 0.194, P = 0.044). The structure of linkage disequilibrium in pairs of alleles differed between Tuvinians and Russians. In total, the results suggest ethnic specificity of the distribution and pathogenetic significance of the alleles of the TB susceptibility genes.

Представлены результаты первого отечественного исследования полиморфизма генов подверженности туберкулезу (SLC11A1, VDR, IL12B, IL1B, IL1RN) у тувинцев Республики Тыва и русских жителей г. Томска. Установлено, что у тувинцев, по сравнению с русскими, статистически значимо повышение частоты потенциально патологических аллелей исследованных генов: SLC11A1*543N (0.139 и 0.043 для тувинцев и русских соответственно, р=4.6Е-5); IL12B* 1188С (0.378 и 0.174 соответственно, р= 1.1Е-8); VDR*b (0.825 и 0.532 соответственно, р = 3.2Е-16); IL1B*(+3953Al) (0.865 и 0.806 соответственно, р = 0.035) и IL1RN*А1 (0.849 и 0.786 соответственно, р = 0.030). В то же время, ассоциации с заболеванием ни с одним из этих аллелей у тувинцев не обнаружено, однако у русских, больных туберкулезом, по сравнению с контролем, выше частота следующих аллелей: IL1RN*A2 (0.258 и 0.186 соответственно, р = 0.024), SLC11А1*274Т (0.251 и 0.164 соответственно, р = 0.009), IL12B*1188C (0.240 и 0.174 соответственно, р = 0.044), IL1В* (+3953А2) (0.259 и 0.194 соответственно, р - 0.044). Структура неравновесия по сцеплению между парами исследованных аллелей у тувинцев и русских неодинакова. В целом, данные свидетельствуют об этнической специфичности распространения и патогенетической значимости аллелей генов подверженности туберкулезу.

The genetic demographic structure of 12 rural populations from eight uluses of Sakha Republic (Yakutia) has been analyzed. The ethnic, sex, and age composition of the population and the reproductive parameters of women that have completed and have not completed the reproductive period are reported. Crow’s indices have been estimated in representatives of three indigenous ethnic groups (Yakuts, Evens, and Evenks).