Цель. Изучение ассоциации вариабельных сайтов G-1082A (rs3024491) и C-592A (rs1800872) гена IL10 с годовым исходом у больных острым коронарным синдромом без подъёма сегмента ST (ОКСбпST). Материал и методы. В исследование включено 178 пациентов с ОКСбпST, у которых определены полиморфизмы C-592А (rs1800872) и G-1082А (rs3024491) гена IL10. Генотипирование с помощью TaqMan-проб проводилось на амплификаторе “iCycler iQ” (BIO-RAD, США). В группу контроля вошли 185 относительно здоровых жителей г. Кемерово. У 93 пациентов была изучена концентрация в крови интерлейкина-10 (ИЛ-10) методом твёрдофазного иммуноферментного анализа с использованием наборов реактивов BIOSOURCE (Бельгия). Референсные значения ИЛ-10 определены на уровне 2,98 (1,75-4,31) пг/мл. На годовом этапе “конечные точки” развились у 42 (23,5%) пациентов, прогрессирующая стенокардия - у 30 (16,8%) пациентов, кардиоваскулярная смертность в течение года составила 1,1% (n=2), нефатальный инфаркт миокарда развился у шести (3,4%), ишемический инсульт - у четырех (2,3%) пациентов. Результаты. При сравнении концентраций ИЛ-10 у пациентов с ОКСбпST с референсными значениями уровня в крови здоровых жителей г. Кемерово выявлена значимо низкая концентрация данного цитокина у пациентов с ОКСбпST (0,38 против 2,98 пг/мл; р=0,001). Анализ ассоциации изучаемых вариабельных сайтов гена IL-10 с неблагоприятными исходами в течение года показал, что генотип А/С rs3024491 (G-1082А) гена IL10 ассоциирован с развитием неблагоприятного исхода в течение года после перенесенного ОКСбпST. Анализ дожития до наступления “конечной точки” в течение 12 месяцев показал, что наиболее неблагоприятным является гетерозиготное носительство генотипа А/С rs3024491 (G-1082А) гена IL10 генотип (р=0,048). Заключение. У пациентов с ОКСбпST генотип С/С rs1800872 (С-592А) гена IL10 ассоциирован со многими факторами кардиоваскулярного риска, тогда как генотип А/А rs3024491 (G-1082А), напротив, имеет ассоциации с протективными факторами. Генотип А/С полиморфного варианта rs3024491 (G-1082А) гена IL10 ассоциирован с развитием неблагоприятных годовых исходов у больных ОКСбпST.

Болезнь Паркинсона - одно из наиболее тяжелых и распространенных нейродегенеративных заболеваний. Подавляющее большинство случаев заболевания представлено спорадической формой мультифакторной природы. Важную роль в развитии болезни Паркинсона играет генетическая предрасположенность. Цель исследования - изучение ассоциаций полиморфизмов гена COMT, кодирующего фермент катаболизма дофамина катехол-О-метилтрансферазу, с болезнью Паркинсона. Материал и методы. Обследовано 232 пациента с диагнозом «болезнь Паркинсона» и 127 здоровых лиц русской популяции Сибирского региона. В качестве материала для исследования была использована венозная кровь. Проведено генотипирование семи однонуклеотидных полиморфизмов (rs4680, rs6269, rs4633, rs4818, rs769224, rs165774, rs174696) гена COMT. Статистическая обработка результатов проводилась при помощи программы SPSS 17.0. Результаты. Выявлена достоверная ассоциация полиморфизма rs165774 с болезнью Паркинсона, что подтверждает роль полиморфных особенностей гена катехол-О-метилтрансферазы в патофизиологических процессах при болезни Паркинсона.

The review discusses issues related to the importance of interaction between genetic and environmental factors for the implementation of the genetic program of individuals and determining the level of health. Data on the importance of some nutrients (vitamins, bio-elements) for formation of health, about a role of genetic factors in maintenance of a homeostasis of biologically active substances, about associations of the genes involved in a metabolism of nutrients with various pathologies, and examples of modification of effects of genetic polymorphic variants on risk of development of common diseases by various factors (bio-elements and other components of a diet, adverse factors of environment, drugs, etc.) are presented.

В обзоре обсуждается проблема значимости взаимодействия генетических и средовых факторов для реализации генетической программы индивидов и определения их здоровья. Приведены сведения о важности некоторых нутриентов (витаминов, биоэлементов) для формирования здоровья, о значении генетических факторов в поддержании гомеостаза биологически активных веществ, об ассоциированности полиморфных вариантов генов, вовлеченных в метаболизм нутриентов, с патологическими состояниями, а также примеры модификаций эффектов вариантов генов на риск развития заболеваний многофакторной природы различными средовыми факторами (биоэлементами и другими компонентами диеты, неблагоприятными факторами среды, лекарственными препаратами и др.).

Атопическая бронхиальная астма (АБА) является многофакторным заболеванием и ее развитие зависит как от множества факторов окружающей среды, так и генетической компоненты. Генетические факторы риска развития АБА могут влиять на фенотип заболевания и степень контроля его течения. Существенный вклад в патогенез АБА вносят гены цитокинов, участвующие в иммунном ответе, развитии и активации воспаления дыхательных путей. Предполагается, что степень контроля заболевания является генно-опосредованным процессом и во многом зависит от наличия того или иного аллельного варианта в генах медиаторов, участвующих в патогенезе АБА. Знания о генетических маркерах позволит прогнозировать течение атопической бронхиальной астмы у детей. Исследование проведено для оценки ассоциации генов провоспалительных и противовоспалительных цитокинов с уровнем контроля течения атопической бронхиальной астмы (АБА). У больных детей с контролируемым (КАБА) и неконтролируемым (НАБА) течением заболевания (n = 110), а также в популяционной выборке (n = 138) изучены 11 полиморфизмов генов IL2 (rs2069762), IL4 (rs2070874 и rs2243250), IL5 (rs2069812), IL10 (rs1800872 и rs1800896), IL12B (rs3212227), TNFA (rs1800629 и rs1800630), TGFB1 (rs1800469), IFNG (rs2069705), кодирующих цитокины, принимающие активное участие в развитии и регуляции аллергического воспаления. По данным проведенного исследования, у европеоидов Восточной Сибири частоты аллелей и генотипов по изученным полиморфизмам соответствуют таковым в других европеоидных популяциях мира. Получены статистически значимые отличия между группой НАБА и контрольной выборкой по частотам генотипов IL2 (rs2069762): генотип GG чаще встречается в контрольной группе (14,1% по сравнению с 5,9% в группе НАБА, р = 0,03). Показано, что аллель IL2*T или генотип ТТ (rs2069762) предрасполагает к развитию неконтролируемого течения АБА. При сравнении гаплотипов IL4 (rs2070874 и rs2243250) с поправкой на пол и возраст, с использованием аддитивной модели наследования, показано, что наиболее часто встречающийся гаплотип СC (частота в группах АБА/КАБА/НАБА составляет 0,75/0,76/0,74 соответственно) является протективным в отношении риска развития атопической бронхиальной астмы (RR 0,53; SE 0,32; p = 0,0439). Сравнительный анализ гаплотипов TNFA (rs1800629 и rs1800630) с поправкой на пол и возраст, с использованием аддитивной модели наследования, показал, что гаплотип GC является протективным в отношении риска развития АБА (RR 0,59±0,17; р = 0,0028), а гаплотип GA - предрасполагающим к заболеванию (RR 2,07±0,25; р = 0,0034). Это характерно для атопической бронхиальной астмы вне зависимости от степени контроля заболевания (КАБА GA: RR 1,93±1,2; p = 0,0414; НАБА GA: RR 2,43±0,31; p = 0,0051). Установлено, что гены цитокинов вносят вклад в развитие АБА у детей. Эти данные для европеоидной популяции Восточной Сибири получены впервые и представляют интерес с точки зрения пополнения данных о вкладе полиморфизма генов цитокинов в развитие атопической бронхиальной астмы и контроля течения заболевания у детей.

В обзоре проанализированы результаты изучения молекулярно-генетических механизмов развития патологических процессов в пародонте. Приведены данные, свидетельствующие о связи генов GLT6D1, ANRIL, DEFB1, IL-1, IL-10, COX 2, MMP-9, NPY с возникновением заболеваний пародонта. Представлены сведения об основных генетических синдромах, которым в большинстве случаев сопутствуют болезни пародонта. Делается вывод, что более глубокое понимание молекулярно-генетических процессов в пародонте может стать основой для разработки новых эффективных программ профилактики и лечения пародонтитов.

The review analyzes the results of studying the molecular genetic mechanisms of the development of pathological processes in the periodontium. The data showing the connection of the genes GLT6D1, ANRIL, DEFB1, IL-1, IL-10, COX 2, MMP-9, NPY with the appearance of periodontal diseases is presented. Data on the main genetic syndromes, which in most cases are accompanied by periodontal diseases, are presented. It is concluded that a deeper understanding of molecular-genetic processes in the periodontium can be the basis for the development of new effective programs for the prevention and treatment of periodontitis.

The review is focused on current views on the structural variation of genome of somatic cells as components related to atherosclerosis. The original data presented on the variation spectrum of DNA areas copies in peripheral blood leucocytes and arterial cells in human atherosclerosis. The future directions sketched for the research on somatic cells genome variation with the aim for pathogenetics of multifactorial diseases.

В обзоре рассмотрены существующие представления о структурной изменчивости генома соматических клеток как компоненты, связанной с атеросклерозом. Приведены результаты собственного исследования о спектре вариаций числа копий участков ДНК в лейкоцитах периферической крови и клетках артерий при их атеросклеротическом поражении у человека. Обозначены перспективы исследования структурной вариабельности генома соматических клеток для понимания патогенетики многофакторных заболеваний человека.

Identification of the genes, different in the level of DNA methylation among the cells of intact or atherosclerotic arteries in patients with coronary and carotid atherosclerosis. Material and methods. Into the study group, atherosclerosis patients were included, who had undergone coronary bypass surgery or carotid endarterctomy, and relatively healthy individuals. The assessment of methylation level of various 27578 CpG-sites/14475 genes was done with the microchip Infinium Human Methylation27 BeadChip (Illumina) in the specimens of atherosclerotically changed coronary (n=6), carotid (n=6), intact internal thoracal arteries (n=8) and large saphenous veins (n=8). Level of methylation in the locus 2q31.1 (HOXD4/HOXD3/ MIR10B) was measured with bisulphite pyrosequencing of DNA in the vessels specimens and leucocytes of the same patients (n=130), as in the leucocytes of relatively healthy men (n=110). Results. In the cells of atherosclerotically changed arteries, comparing to intact vessels, the change of methylation level by 20% and more is found for 46 CpG-sites/ 42 genes (pFDR <0,05). Of those 8 genes (TLR4, TRAF1, ABCB11, NPR2, ALOX12, TMEM182, ALX4 и FABP1) are known candidates for atherosclerosis or its risk factors by the results of genetics studies. Most number of CpG sites, where the highest decrease of methylation found in the cells of atherosclerotically changed arteries comparing to the intact, were located in the locus 2q31.1, with the genes HOXD4/HOXD3/MIR10B. In leucocytes of patients the level of methylation of one of the CpG-sites in locus 2q31.1 (HOXD4/HOXD3/MIR10B) higher in smokers (18±5%), than non-smokers (14±6%; p<0,05), and level of methylation of one of CpG-sites in this area of genome is lower in those who had previous ischemic stroke (18±8%) comparing to those with no stroke anamnesis (20±7%; p<0,05). Conclusion. Lowest part of the identifiable differently methylated genes among the cells of lesioned arteries and intact vessels is related to atherosclerosis or its risk factors as a result of genetic studies on genetic associations. It is found that the change of methylation level in locus 2q31.1 (HOXD4/HOXD3/MIR10B) is associated with atherosclerotic lesion of arteries, and in leucocytes of patients the grade of methylation in the studied region of genome is related to smoking and ischemic stroke.

Цель. Идентификация генов, различающихся по уровню метилирования ДНК между клетками артерий, пораженных атеросклерозом, и интактными сосудами у пациентов с атеросклеротическим поражением коронарных и сонных артерий. Материал и методы. В группу обследования вошли пациенты с атеросклерозом, которым проведены плановые операции аортокоронарного шунтирования и каротидной эндартерэктомии, а также относительно здоровые индивиды. Оценка уровня метилирования отдельных 27578 CpG-сайтов/14475 генов выполнена с использованием микрочипа Infinium Human Methylation27 BeadChip (Illumina) в образцах теросклеротически измененных коронарных (n=6) и сонных артерий (САБ, n=6), интактных внутренних грудных артерий (n=8) и больших подкожных вен (n=8) пациентов. Уровень метилирования в локусе 2q31.1 (HOXD4/HOXD3/MIR10B) определялся с помощью бисульфитного пиросеквенирования ДНК в образцах САБ и лейкоцитах у одних и тех же пациентов (n=130), а также в лейкоцитах относительно здоровых мужчин (n=110). Статистическая обработка данных проводилась с помощью пакетов профессиональных программ. Результаты. В клетках атеросклеротически измененных артерий по сравнению с интактными сосудами изменение уровня метилирования на 20% и более установлено для 46 CpG-сайтов/42 генов (pFDR<0,05). Из них 8 генов (TLR4, TRAF1, ABCB11, NPR2, ALOX12, TMEM182, ALX4 и FABP1) являются известными кандидатами для атеросклероза/его факторов риска в результате исследований генетических ассоциаций. Наибольшее количество CpG-сайтов, в которых выявлено существенное снижение уровня метилирования в клетках атеросклеротически измененных артерий по сравнению с интактными сосудами, располагалось в локусе 2q31.1, содержащем гены HOXD4/HOXD3/MIR10B. В лейкоцитах пациентов уровень метилирования одного из CpG-сайтов в локусе 2q31.1 (HOXD4/HOXD3/MIR10B) выше у курящих (18±5%), чем у некурящих (14±6%; p<0,05), а уровень метилирования другого CpG-сайта в данном регионе генома ниже у тех, кто перенес ишемический инсульт (18±8%) по сравнению с индивидами без инсульта в анамнезе (20±7%; p<0,05). Заключение. Меньшая доля идентифицированных дифференциально метилированных генов между клетками артерий, пораженных атеросклерозом, и интактными сосудами связана с атеросклерозом/его факторами риска в результате исследований генетических ассоциаций. Установлено, что изменение уровня метилирования в локусе 2q31.1 (HOXD4/HOXD3/MIR10B) ассоциировано с атеросклеротическим поражением артерий, а в лейкоцитах пациентов уровень метилирования в данном регионе генома связан с курением и ишемическим инсультом.

Цель исследования. Оценить возможность улучшения прогностической способности шкалы риска GRACE 2.0 при помощи дополнительного учета генотипов полиморфизмов rs4291 и rs4343 гена ACE. Материал и методы. В регистровое проспективное исследование включено 353 пациентов с острым коронарным синдромом (ОКС). Определение генотипов и аллелей полиморфизмов rs4343 и rs4291 гена ACE проводилось на приборе «iCycler iQ» (BIO-RAD, США) методом TaqMan-проб. Через 36 месяцев после индексного события проведен телефонный контакт с больными или его родственниками с целью идентификации конечных точек. Выяснить статус пациента «жив или мертв» удалось в 96,6±1,0% случаев. Летальность от любых причин составила 11,4±1,7% (n=39), кардиваскулярная летальность - 7,9±1,5% (n=26). Результаты. Первым этапом исследования выяснено, что как полиморфизм rs4343, так и полиморфизм rs4291 гена ACE ассоциированы с высоким риском смерти в течение трёх лет после ОКС. При этом связь данных вариантов более сильная с кардиоваскулярной летальностью, чем с общей, а выявление больных с сочетанием рисковых генотипов ТТ полиморфизма rs4291 и GG полиморфизма rs4343 позволяет ещё с большей достоверностью идентифицировать группу крайне высокого риска смерти в течение трёх лет после ОКС (отношения шансов 9,10 (3,81-21,71), p<0,001, х2=33,20). Построение ROC-кривых выявило, что сочетание полиморфизмов rs4291 и rs4343 гена ACE значительно улучшало прогнозирование шкалой GRACE вышеописанных конечных точек в течение трёх лет наблюдения после ОКС. Значения площади под ROC-кривыми при прогнозировании общей летальности составили, соответственно, для шкал GRACE и GRACE+ACE 0,71 (0,62-0,80) и 0,78 (0,70-0,86) (p<0,00001), при прогнозировании кардиоваскулярной летальности - 0,72 (0,62-0,81) и 0,81 (0,73-0,88) (p<0,00001). Заключение. Модификация шкалы GRACE 2.0 добавлением данных о генотипах полиморфизмов rs4291 и rs4343 гена ACE достоверно улучшает прогнозирование летальности в течение трех лет после ОКС.

This review provides modern data on the spectrum and the functional significance of micro-RNAs involved in atherogenesis and on some regulatory mechanisms that ensure the functioning of this class of molecules. We also outline some examples of micro-RNAs use as diagnostic and therapeutic targets.

В настоящем обзоре представлены современные данные о спектре и функциональной значимости микро-РНК, вовлеченных в атерогенез, а также некоторых регуляторных механизмах, обеспечивающих функционирование молекул данного класса. Приводятся примеры использования микро-РНК в качестве диагностических и терапевтических мишеней.

Цель исследования. В обзоре освещены вопросы, связанные с изучением роли генетической компоненты в формировании подверженности к привычному невынашиванию беременности (ПНБ) посредством обобщенного количественного анализа данных. Материал и методы. В обзор включены результаты зарубежных и отечественных метаанализов, найденных в базе данных PubMed по данной тематике, опубликованные за последние 10 лет. Результаты. Проведено обобщение данных, полученных в метаанализах исследований ассоциации аллельных вариантов генов-кандидатов с ПНБ, и охарактеризована функциональная значимость ряда ассоциированных полиморфных маркеров. Показана важность учета этнической принадлежности индивидов при изучении роли генетических факторов в развитии данной патологии, а также ген-генных и ген-средовых взаимодействий. Заключение. Создание в перспективе базы данных, включающей результаты ассоциативных исследований с детальным описанием их дизайна (подробные клинические характеристики обследованных индивидов, критерии формирования групп, этническая принадлежность пациентов), будет способствовать получению статистически значимых доказательств роли генетической компоненты в структуре подверженности к ПНБ.

Данный раздел Консенсуса представляет обобщенный российский и международный опыт по диагностике МВ. Представлены современные диагностические критерии заболевания, алгоритм обследования пациентов, а также возможные результаты обследования, в т.ч. по программе неонатального скрининга на МВ. Особое внимание уделено пациентам с пограничными результатами потовой пробы, вызывающими сложности в интерпретации. С полным текстом документа можно ознакомиться на сайтах: http://www.med-gen.ru,      http://www.mukoviscidoz.org .