We tested the association of deletion polymorphism in the GSTT1 and GSTM1 genes for glutathione S-transferases and the A313G single-nucleotide polymorphism in the GSTP1 gene with cirrhosis morbidity and 4-year survival rate among residents of the Tomsk region, West Siberia. The homozygous deletion of the GSTM1 gene (null genotype) proved to be a protective factor against alcoholic and mixed (viral and alcoholic) liver cirrhosis. The frequency of this genotype in patients of the combined group having cirrhosis of any etiology was 39.2%, in patients with alcoholic cirrhosis it was 39.0%, and in patients with mixed cirrhosis it was 34.2%. This genotype was much more frequent among patients of the control group: 64.6%. The GSTM1 null genotype and the GSTP1 A313G polymorphic variant correlated with survival rate. The survivors had a higher GSTM1 null genotype frequency than the dead patients, 46.6 and 30.2%, respectively; a higher frequency of the GSTP1 AA genotype, 63.1 and 40.5%; and a lower frequency of the GSTP1 AG (A313G) genotype (31.1 and 51.2%). The survival rate in patients with the GSTP1 AA genotype was 2.5 times as high as in GG or AG genotype carriers. In patients with the GSTM1 null genotype, the survival rate was twice as high as in patients without the deletion. The 4-year fatal case probability in patients having the heterozygous GSTP1 AG genotype was 2.3 times higher than in patients with the homozygous AA or GG genotypes.

Изучена ассоциация делеционного полиморфизма генов глутатион-S-трансфераз GSTT1 и GSTM1 и однонуклеотидного полиморфизма A313G гена GSTP1 с заболеваемостью циррозом печени (ЦП) и выживаемостью больных в течение 4-летнего периода наблюдения. Исследование проведено на группе больных, проживающих в городе Томске и Томской области. Показано, что “нулевой” генотип гена GSTM1 является протективным фактором развития ЦП алкогольной и смешанной (вирусы гепатита C и B, алкоголь) этиологии. Частота “нулевого” генотипа гена GSTM1 в объединенной группе больных ЦП (без разделения по этиологическому фактору) составляет 39.2%, у больных алкогольным циррозом – 39% и при заболевании смешанной этиологии (HCV или HBV + алкоголь) – 34.2%, что значительно ниже, чем в контрольной группе (64.6%). Выявлено, что делеционный полиморфизм гена GSTM1 и вариант A313G гена GSTP1 коррелируют с выживаемостью больных ЦП. Так, частота “нулевого” генотипа GSTM1 в группе выживших больных выше (46.6%), чем в группе умерших (30.2%). Кроме того, в группе выживших частота генотипа АА гена GSTP1 выше, а генотипа AG ниже по сравнению с умершими за тот же период (63.1 против 40.5 и 31.1% против 51.2% соответственно). Выживаемость больных ЦП за 4-летний период в 2.5 раза выше у носителей генотипа АА гена GSTP1, чем у носителей GG и AG генотипов, и в 2 раза выше у пациентов с “нулевым” GSTM1 генотипом по сравнению с носителями этого гена. Вероятность летального исхода в течение 4 лет у гетерозигот AG (A313G) гена GSTP1 в 2.3 раза выше, чем у носителей гомозиготных генотипов AA и GG.

Polymorphic markers were studied in mitochondrial DNA and the nuclear POLG1 gene, coding for mitochondrial DNA polymerase γ. Their frequencies were compared between healthy individuals and patients with arterial hypertension, as well as between patients with and without left ventricular hypertrophy. The healthy group was found not to be clearly dominated by the C allele of MspI polymorphism in POLG1. Mitochondrial haplogroup H was more frequent (OR = 0.42; 95%CI 0.17–0.98; p = 0.043) in patients without left ventricular hypertrophy than in patients having this complication. Haplogroup T was more often detected in patients with left ventricular hypertrophy (OR = 6.16; 95%CI 1.17–9.74; p = 0.018). This result suggests the implication of mitochondrial DNA in hereditary susceptibility to cardiovascular diseases.

Изучено влияние полиморфных вариантов митохондриальной ДНК (мтДНК) и гена POLG1 митохондриальной ДНК-полимеразы на развитие и течение эссенциальной гипертензии. Сравнение полиморфизма этих локусов в группах больных артериальной гипертонией и здоровых лиц, а также в группах больных артериальной гипертонией с гипертрофией левого желудочка и без этой патологии не выявило статистически значимых различий в распределении аллеля C MspI-полиморфизма гена POLG1. Выявлена более высокая частота гаплогруппы Н мтДНК в группе больных без гипертрофии левого желудочка по сравнению с группой, имеющей это осложнение (OR = 0.42; 95%CI 0.17–0.98; р = 0.043). Отмечено накопление гаплогруппы Т мтДНК в группе больных с гипертрофией левого желудочка (OR = 6.16; 95%CI 1.17–9.74; р = 0.018). Полученные результаты позволяют предположить, что полиморфизм митохондриального генома вовлечен в формирование предрасположенности к гипертрофии левого желудочка при артериальной гипертензии. Ключевые слова: артериальная гипертония, гипертрофия левого желудочка, анализ ассоциаций, многофакторные заболевания, мтДНК, ген POLG1.

Риски, связанные с воздействием ионизирующего излучения на человека в условиях профессиональной деятельности, остаются предметом пристального внимания. При этом особое значение имеет слабо изученное действие ионизирующего излучения на частоту числовых хромосомных нарушений в соматических клетках человека. Целью настоящего исследования явилась характеристика механизмов радиационно-индуцированной анеуплоидии при воздействии инкорпорированного плутония-239 (239Pu) в соматических клетках работников ядерно-химического производства. Впервые обнаружены значимые различия между группой индивидов с инкорпорированным 239Pu и контрольной группой по частоте анеуплоидии по хромосомам 2, 7, 8, 12 и Y. Установлено, что основным механизмом возникновения анеуплоидии при воздействии инкорпорированного 239Pu является хромосомное нерасхождение.

Demographic and clinical genetic parameters used for simulation modeling of the prevalence of spinocerebellar ataxia type 1 (SCA1) in Yakut populations are described. Demographic parameters of simulated populations and the clinical genetic characteristics of carriers of the SCA1 mutant allele in them have been compared with actual data on Abyisky and Ust-Aldansky uluses of the Republic of Sakha (Yakutia). The results of a series of simulation experiments (without migration or spontaneous mutagenesis) agree with the conclusion that the high prevalence of rate of spinocerebellar ataxia type 1 in Yakut populations may be maintained because of their specific demographic structure. Prediction of the disease prevalence has shown that it will take about 1290 years for natural selection to eliminate the mutation from the population. If medical genetic counseling (MGC) is offered to 1% of the carriers of the mutation, this period will be reduced to 200 years.

Описаны демографические и клинико-генетические параметры, использованные для имитационного моделирования распространения спиноцеребеллярной атаксии I типа в якутских популяциях. Проводится сравнительный анализ демографических показателей населения и клинико-генетических характеристик носителей мутантного аллеля гена SCA1, полученных в смоделированных популяциях, с реальными данными по Абыйскому и Усть-Алданскому улусам Республики Саха (Якутия). Серия имитационных экспериментов (без миграций и без спонтанного мутагенеза) не противоречит выводу, что высокий уровень заболеваемости спиноцеребеллярной атаксией I типа в популяциях Якутии может поддерживаться за счет особенностей их демографической структуры. Прогноз распространения заболевания показывает, что для элиминации мутации из популяции за счет естественного отбора понадобится около 1290 лет. При оказании медико-генетической помощи 1% носителей мутации этот период сокращается до 200 лет.

Rural and urban settlements of the Republic of Sakha (Yakutia) are characterized by intense marriage migrations: both indigenous residents of different uluses (districts) of the republic (7–30%) and migrants from outside Yakutia (7–29%) contract marriages in five administrative centers analyzed in this respect. All the populations studied are characterized by a wide geographic range of the birthplaces of persons contracted marriages there (from 14 to 24 uluses of Yakutia), without any predominant migration flow from one district to another. The proportion of homolocal marriages among indigenous ethnic groups (Evenks, Evens, and Yukagirs) is as high as 75–100%; this proportion among Yakuts varies from 26 to 68%; heterolocal marriages are more characteristic of Russian immigrants (41–95%). Positive assortative marriages among persons with the same birthplaces have been found in all populations except for Momsky ulus.

Для сельских и городских населенных пунктов (обследовано 5 административных центров) Республики Саха (Якутия) характерны интенсивные брачные миграции: среди вступивших в брак регистрировались как уроженцы различных улусов республики (от 7 до 30%), так и мигранты из-за пределов Якутии (7–29%). Все обследованные популяции характеризуются широкой географией мест рождения супругов (от 14 до 24 улусов) при отсутствии направленных (преимущественных) миграционных потоков из одного района в другой. Показано высокое распространение гомолокальных браков среди коренных этнических групп (эвенки, эвены, юкагиры) – от 75 до 100%; доля гомолокальных браков среди якутов варьировала от 26 до 68%; для пришлого населения (русские) более характерно заключение гетеролокальных браков (41–95%). В большинстве обследованных популяций выявлена положительная брачная ассортативность по местам рождения женихов и невест (исключением явился Момский улус).

The population dynamics and changes in the sex and age structure of the Shor populations of four rural district municipalities of Tashtagolskii raion of Kemerovo oblast (Kyzyl-Shorskii, Ust-Anzasskii, Ust-Kolzasskii, and Ust-Kabyrzinsskii) with time have been analyzed. The Shor populations have been found to have contained a high proportion of people under 18 years of age during two periods, 1940–1955 and 1970–1975 (38.12–46.38 and 40.98–54.97%, respectively). However, the population reproduction pattern changed into the “reduced” one in all the municipalities studied by the early 2000s. Although there are some regional variations, a common trend towards rural population aging has formed: the man age in the Tashtagolskii raion population has increased by 7.52 and 6.94 years for men and women, respectively, during two generations; the natural sex ratio has been disturbed in both the prereproductive and reproductive populations. The total population size and effective reproductive size have decreased in three out of the four rural subpopulations studied.

Представлены результаты анализа динамики численности и половозрастной структуры шорского населения четырех сельских территориальных управлений Таштагольского района Кемеровской области – Кызыл-Шорского, Усть-Анзасского, Усть-Колзасского, Усть-Кабырзинского. Для шорских популяций показана высокая доля лиц в возрасте до 18 лет в двух временных периодах – 1940–55 гг. и 1970–75 гг. (38.12–46.38% и 40.98–54.97% соответственно), но к началу 2000-х годов наблюдается смена типа воспроизводства на “суженный” в населении всех изученных территориальных управлений. Несмотря на территориальные вариации, наметилась общая тенденция – старение сельского населения: средний возраст в целом по району за два поколения увеличивается у мужчин на 7.52, у женщин на 6.94 года; нарушено естественное соотношение полов в дорепродуктивной и репродуктивной части популяции. В трех из четырех исследованных сельских субпопуляций показано снижение общей численности и эффективно-репродуктивного объема.

A simulation model has been developed for predicting the distribution of trinucleotide repeat expansion diseases in human populations. The interface of the software used to run this model presents the options for simulating natural reproduction of a population, with the population demographic parameters taken into account, and for simulating the appearance of a dynamic mutation in populations, transmission of the mutant gene from parents to offspring, and the effect of the phenotypic expression of the disease (the patients’ life expectancy and birthrate) on the transmission of the mutant allele in the patients’ families and its accumulation in the population.

Разработана имитационная модель для прогнозирования распространения заболеваний экспансии тринуклеотидных повторов в популяциях человека. Интерфейс компьютерной программы, реализующей данную модель, включает в себя как моделирование естественного воспроизводства населения с учетом демографических параметров конкретной популяции, так и имитацию появления динамической мутации в популяции, передачу мутантного гена от родителей потомкам и влияние фенотипического проявления заболевания (продолжительности жизни больных и уровня рождаемости) на передачу мутантного аллеля в семьях больных и накопление его в популяции.

Marriage structure has been analyzed in the populations of the administrative centers of five uluses of the Republic of Sakha (Yakutia). The populations studied differ from one another with respect to ethnic composition, namely in the ratio between the indigenous and immigrant populations (the indigenous populations are larger in three uluses), in the proportions of representatives of indigenous ethnic groups among men and women contracting marriages, and in the frequencies of monoethnic and interethnic marriages. Positive assortative marriage among persons of the same ethnic group has been demonstrated. The total inbreeding estimated by isonymy (Fit) varies from 0 to 0.007576.

Приведены результаты анализа брачной структуры населения из административных центров пяти улусов Республики Саха (Якутия). Обследованные популяции различаются между собой по национальному составу как в соотношении коренного и пришлого населения (в трех улусах преобладает коренное население), так и по составу представителей коренных этнических групп среди женихов и невест; по распространенности одно- и межнациональных браков. Показана положительная брачная ассортативность по национальной принадлежности супругов. Величина тотального инбридинга по изонимии Fit варьирует от 0 до 0.007576.